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【调剂】北京石油化工学院2024年16个专业接受调剂
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467435034

新虫 (初入文坛)

[求助] 一段序列分成三段扩增,直接用第一段的F和第三段的R扩增,得到的条带不一样。

我想要克隆一个病毒里的一段序列,因为比较长,所以分成了三段设计引物,分别是123段的F和R,其中因为后面要同源重组进行连接,所以1R和2F还有2R与3F是互补的,但是1和3两段序列都已经扩增出来连上pMD19T了,2片段一直扩增不出来,用的是taq酶,之后就想要不用高保真直接扩增这一整段4000bp的序列,就直接用1F和3R两个引物直接扩增。但结果是扩增出来了,也用pEASY连上了,但是测序结果出来不是我要的目的片段的序列,是一个叫食酸戴尔福特菌的菌株序列,但是条带大小是我的目的片段的大小啊,这是没连上还是我PCR扩增出来的就不是我的片段呀,有没有大神帮帮忙。
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xinxinjin

银虫 (职业作家)

你的病毒基因组模板用DNA和RNA酶没

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2楼2022-04-29 23:14:35
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467435034

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by xinxinjin at 2022-04-29 23:14:35
你的病毒基因组模板用DNA和RNA酶没

病毒是rna病毒,反转录用cdna扩增的,没有消化

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3楼2022-05-01 15:56:58
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ybzberlin

新虫 (初入文坛)

实验室有其他酶吗,可以试试不同的酶来PCR片段2

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4楼2022-05-02 12:19:39
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467435034

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by ybzberlin at 2022-05-02 12:19:39
实验室有其他酶吗,可以试试不同的酶来PCR片段2

taq酶也扩增不出来
5楼2022-05-09 08:58:57
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生物five啊

新虫 (初入文坛)

想问一下您1R和2F是如何互补的呀

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6楼2023-10-26 18:44:37
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天照小星星

新虫 (小有名气)

测序识别存在相识序列 不一定名称对  你可以扩的1f3r作为模板扩2片段来验证是否正确
可加我qq 2589149676

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7楼2023-11-04 21:49:24
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