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司空见惯

新虫 (小有名气)

[求助] Cell transform ab轴转换矩阵已有1人参与

Cell transform 问题求助
我有两个晶体同构的,但是发现不对称单元ab轴是长度相同,但是取向不同。
听说可以在Xprep转换过来,但是ab轴转换的矩阵是多少呢?

网上找到的做法:
5.1空间群转换
Xprep进行空间群转换现提供利用Xprep进行矩阵转换从而达到P21/n到 P21/c的方法。
(1)打开-一个ins或者res文件
(2) olex2 最下方键入xprep命令。打开xprep程序
(3)选P格子
(4) [H] Search for higher metric symmetry时选择MONOCLINIC
(5)确定完格子后选[U] UNIT-CELL transformation
(6)再选[O] Input matrix to transform ORIGINAL cell
(7)输入转换矩阵 1 0 0 0 -1 0 -1 0 -1
(8)再用[S]确定空间群即可。剩下的过程同平常使用xprep相同
(9)最后用新生成的ins 和hkl进行精修即可。
ps:如果需要其他转换如ab互换、ac互换等只需要在(7)中输入相应矩阵即可。
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tetragonal

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

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感谢参与,应助指数 +1
司空见惯: 金币+100, ★★★★★最佳答案 2022-01-07 16:06:50
只是ab轴互换的话c轴不变,这个矩阵很好写
01010000-1

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单晶测试和解析,有需要的私信。
2楼2022-01-06 18:21:35
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司空见惯

新虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by tetragonal at 2022-01-06 18:21:35
只是ab轴互换的话c轴不变,这个矩阵很好写
01010000-1

你好,有人建议用010 -100 001,但是好像都没啥变化
3楼2022-01-07 09:29:36
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tetragonal

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 司空见惯 at 2022-01-07 09:29:36
你好,有人建议用010 -100 001,但是好像都没啥变化...

主要是你要从头开始做,做单胞和还原,校正都是按照你想要的晶胞方式来只是最后精修的时候把矩阵加上,这样才是你要的结果

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单晶测试和解析,有需要的私信。
4楼2022-01-07 13:58:18
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司空见惯

新虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by tetragonal at 2022-01-07 13:58:18
主要是你要从头开始做,做单胞和还原,校正都是按照你想要的晶胞方式来只是最后精修的时候把矩阵加上,这样才是你要的结果
...

重新还原一下,按照你的矩阵代码,搞定了!   非常感谢
5楼2022-01-07 16:06:30
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