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pylau1988

新虫 (小有名气)


[交流] 基因克隆缺失碱基疑问

请问各位专家,我根据转录组测序得到一个基因的CDS序列,设计引物扩增该基因的全长CDS,PCR产物经测序后发现,靠近3端的中间部分缺失了39个碱基(缺失后也能正常翻译,就是跟转录组比少了13个氨基酸),请问这是什么原因造成的?是PCR扩增出问题还是克隆到了该基因的剪接突变基因?谢谢大家
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534720018

铁杆木虫 (正式写手)



pylau1988(金币+1): 谢谢参与
多测几次看看先

发自小木虫Android客户端
3楼2021-10-21 15:07:47
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pylau1988

新虫 (小有名气)


引用回帖:
3楼: Originally posted by 534720018 at 2021-10-21 15:07:47
多测几次看看先

随机挑了3个克隆测序都是缺39个碱基,换了公司测也是同样的结果
4楼2021-10-21 16:24:50
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fuyuandj86

版主 (著名写手)



pylau1988(金币+1): 谢谢参与
剪切拼接异构体

发自小木虫IOS客户端
6楼2021-10-21 17:37:56
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局也土豆

新虫 (小有名气)



pylau1988(金币+1): 谢谢参与
我也有这种情况,出现这种情况应该怎么做呢?继续做还是?

发自小木虫Android客户端
8楼2021-10-22 18:27:45
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pylau1988

新虫 (小有名气)


引用回帖:
8楼: Originally posted by 局也土豆 at 2021-10-22 18:27:45
我也有这种情况,出现这种情况应该怎么做呢?继续做还是?

可以继续做,这也是基因的一种转录本
11楼2021-10-25 11:12:05
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简单回复
tzynew2楼
2021-10-21 14:42   回复  
pylau1988(金币+1): 谢谢参与
o 发自小木虫Android客户端
nono20095楼
2021-10-21 17:16   回复  
pylau1988(金币+1): 谢谢参与
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2021-10-21 22:41   回复  
pylau1988(金币+1): 谢谢参与
2021-10-23 19:53   回复  
pylau1988(金币+1): 谢谢参与
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bjdxyxy10楼
2021-10-24 20:50   回复  
pylau1988(金币+1): 谢谢参与
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