【调剂】北京石油化工学院2024年16个专业接受调剂
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wilsonismal

新虫 (初入文坛)

[求助] 质粒构建过程中,载体上基因大量丢失

各位大佬们,我想将潮霉素抗性基因(1400 bp)连接到一个具有氨苄抗性的载体上(6000 bp)
我是先将载体通过XbaI-HindIII双酶切,切除一个900 bp左右的片段,进行线性化,并通过胶回收进行回收,回收的线性化载体(5000 bp),测序后结果符合预期
潮霉素基因通过PCR进行扩增,扩增后通过消化和PCR回收进行纯化,测序后结果也符合预期
潮霉素基因和线性化的片段分别使用T4 和同源重组进行连接,并分别转化入BL21,Trans10和JM109感受态,并使用有潮霉素和氨苄的抗性平板进行筛选
12小时后,挑取单菌落进行菌落PCR(引物位置在潮霉素基因上),结果呈阳性
挑取阳性菌在含有潮霉素和氨苄的液体LB培养基后培养12小时,提取质粒,并进行sanger测序(测序引物在潮霉素基因两端载体上),结果测序失败,然后使用氨苄通用引物对质粒进行测通,发现质粒长度仅有3900 bp,与预期中连接后6500 bp不符,经比对后发现,质粒中仅保留了质粒的Ori,氨苄抗性(AmpR)和潮霉素抗性(Hygr)区域,其他地方都没了
请问有人遇见过这种问题吗,怎么解决啊
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snoopyzxx

木虫 (著名写手)

为什么要用这几个菌做克隆?这几个菌貌似都不是核酸酶或重组酶缺陷的?质粒在其中本来就不稳定。你要用DH5a或top10

发自小木虫Android客户端
生物资源交流QQ群:1044518333
2楼2021-04-18 14:30:08
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