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【调剂】北京石油化工学院2024年16个专业接受调剂
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胡雅彬

银虫 (小有名气)

[求助] 求助分子生物学大神已有2人参与

最近在构建一批质粒,通过双酶切的方式在目的载体上插入400bp左右的PCR产物。之前一直做得好好的。后来发现连接转化后长的克隆慢慢的在变少,由原来的200-300个克隆一点点的变成100个,50个,20个,再后来变成1-2个,现在直接不长克隆了。
     按照分子生物学实验一旦做不出来就全部换新的原则。我拿了新的未开封的限制性内切酶,T4连接酶,换了新买的氨苄和新买的感受态。然而还是没有长克隆。但我拿着之前构建好的质粒做对照,把质粒稀释到0.08ng还能长100-200个克隆。
     接着我把两个限制性内切酶分别单酶切,发现都能切开。单酶切产物切胶回收,用T4连接酶连接后做转化,也能长出100-200个克隆。然而双酶切就是不长克隆。
     做了十年的分子生物学实验,结果遇到了这种不科学的事情。哪位大神知道哪出了问题?@biostar2009@飞约疯人院@wizardfan@youlinglyw
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ULYSSEESWB

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

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感谢参与,应助指数 +1
胡雅彬: 金币+50, 有帮助 2021-04-23 17:14:32
PCR产物双酶切效率低。使用TA克隆双酶切产物连接,或是无缝克隆

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2021-04-08 16:03:35
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snoopyzxx

木虫 (著名写手)

生物资源交流QQ群:1044518333
3楼2021-04-08 22:37:18
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来如烟雨

新虫 (初入文坛)

我也是,请问你现在做出来了吗?

发自小木虫IOS客户端
4楼2021-04-09 22:24:34
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胡雅彬

银虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by ULYSSEESWB at 2021-04-08 16:03:35
PCR产物双酶切效率低。使用TA克隆双酶切产物连接,或是无缝克隆

嗯。TA克隆后,换了新买的thermo的限制性内切酶,长了三个,而NEB的还是没长。算是知道个大概问题出哪儿了,只是问题还是没解决。
5楼2021-04-11 21:06:32
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ULYSSEESWB

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 胡雅彬 at 2021-04-11 21:06:32
嗯。TA克隆后,换了新买的thermo的限制性内切酶,长了三个,而NEB的还是没长。算是知道个大概问题出哪儿了,只是问题还是没解决。...

自从用了无缝克隆,就再也不想着反复酶切连接的事了
6楼2021-04-12 13:14:40
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胡雅彬

银虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by ULYSSEESWB at 2021-04-12 13:14:40
自从用了无缝克隆,就再也不想着反复酶切连接的事了...

无缝连接出现了点突变。这个让我很郁闷。所以现在要不就是再设计引物,要不就再试双酶切。

发自小木虫Android客户端
7楼2021-04-14 00:51:30
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grm枫

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

无缝克隆最方便,可以重新设计引物扩增连接。
8楼2021-04-14 10:33:56
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liudayeye

木虫 (正式写手)

保护碱基加够了吗?片段引物上的,如果保护碱基没加或者加的不好的话,酶切效率会大大降低的

发自小木虫Android客户端
9楼2021-06-14 18:57:50
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匿名

本帖仅楼主可见
10楼2022-02-13 00:08:41
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