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【调剂】北京石油化工学院2024年16个专业接受调剂
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Yjundong

新虫 (初入文坛)

[求助] lammps模拟

各位老师,朋友,最近在用lammps模拟酚醛树脂升温过程时,老是出现segmentation fault  而停止,想问一下这是什么情况以及解决的办法。先谢谢大家了。
srun: error: m1404: task 12: Segmentation fault
srun: First task exited 60s ago
srun: step:1640128.0 tasks 0-11,13-63: running
srun: step:1640128.0 task 12: exited abnormally
srun: Terminating job step 1640128.0
srun: Job step aborted: Waiting up to 62 seconds for job step to finish.
slurmstepd: error: *** STEP 1640128.0 ON m1404 CANCELLED AT 2021-01-31T19:59:49 ***
srun: error: m1404: tasks 0-11,13-63: Killed

input文件如下:
units         real
dimension     3
boundary      p p p
atom_style    full
read_data     70-N=10.xyz
pair_style    reax/c lmp_control  
pair_coeff        *  *        ffield.reax.cho C H O
neighbor      2 bin
              
# fixes   initial equilibrium to nomal density with npt
fix      1      all npt  temp  300.0 300.0 10.0 iso 1.0 1.0 100.0
fix     2      all qeq/reax 1 0.0 10.0 1.0e-6 reax/c
timestep  0.2                                                         
thermo   100
thermo_style   custom step temp press vol density etotal     
run    10000  

unfix 1
# fixes   initial equilibrium at the nomal density with nvt
fix      3      all nvt  temp  300.0 300.0 100.0
timestep 0.2                                      
thermo   100
thermo_style   custom step temp press vol density etotal   
run     10000

unfix    3
fix      4      all nvt  temp  300.0 2500.0 $(100.0*dt)
fix      5      all reax/c/species  10  10 100 species.out
#compute        myKE all ke/atom
#compute        myPE all pe/atom
#compute        myStress all stress/atom virial
timestep  0.1
thermo   100
thermo_style   custom step temp press etotal
dump   1  all xyz  100 outwz.xyz
#dump   2  all custom 50 basicenergy id type mol x y z c_myKE c_myPE
#dump   3  all custom 50 extraenergy id c_myStress[1] c_myStress[2] c_myStress[3] c_myStress[4] c_myStress[5] c_myStress[6]
run    20000

unfix   4
fix        6     all nvt  temp  2500.0 2500.0 100.0   
timestep 0.1
thermo   100
thermo_style    custom step temp press etotal                                          
run   6000
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