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[交流] 上海交通大学精准医学研究院曾汉林课题组2021诚聘肿瘤生物信息学科研人员及博士后

上海精准医学研究院是上海市教委IV类高峰学科建设项目,由上海交通大学医学院牵头、依托上海交通大学医学院附属第九人民医院进行实体化建设的上海市科技协同创新中心,研究院位于浦东新区锦尊路115号的上海交通大学医学院附属第九人民医院九院科教园区,于2017年12月20日揭牌投入正式运行。

上海精准医学研究院由国家高层次人才雷鸣研究员任执行院长,已建成电镜平台、生物成像平台、数据计算与分析平台、组学平台、蛋白质平台、化学生物学平台等六大平台;具备蛋白质自动化制备表征能力、高分辨结构解析能力、多组学分析能力、高分辨生物成像能力、高性能计算能力的综合技术平台;聚焦干细胞与再生医学、组织工程、病原微生物、生殖与遗传发育、肿瘤与代谢性疾病、组学、结构生物学、生物信息学等与精准医学密切相关的研究领域。上海精准医学研究院计划在五年内引进10-15个独立研究组组长,整体人员规模达到120人左右,成为有全球影响力的精准医学研究基地。

课题组简介:

癌症源发于正常细胞的基因突变累积,并在基因表达的定向调控下,最终演化为生长不受控的一类细胞。本课题组主要利用原代细胞CRISPR/Cas基因编辑系统及转基因小鼠模型等手段,结合外显子/单细胞测序及单细胞活体成像技术,研究基因突变和表达调控如何相互协作推动肿瘤恶性进展;同时,基于人源性组织异种移植瘤(PDX ),细胞系(PDC )及类器官(PDO )等模型开展靶点确证及耐药机制研究。课题组具体研究方向如下:

1)解析癌前病变到恶性肿瘤的突变与非突变进化机制,发现肿瘤早期诊断和预后判断的分子标志物;

2)研究肿瘤表型可塑性参与肿瘤转移和耐药的分子机制;

3)聚焦黏膜/肢端黑色素瘤等中国难治性恶性黑色素瘤亚型的靶点研究及药物筛选。

目前,实验室首次通过对正常黑色素细胞进行基因编辑模拟黑色素瘤的发生过程,并发现抑癌基因CDKN2A缺失是黑色素瘤获得表型可塑性和侵袭转移能力的核心事件。另外,实验室还发现,细胞因子IL6受体家族的应激性转录激活是实体瘤对组蛋白去乙酰化酶(HDAC)抑制剂产生耐药的关键机制。研究组长曾汉林的相关工作发表在Cancer Cell,Nature, Journal of Investigative Dermatology,Nature Communications等学术期刊上,其中Cancer Cell发表两篇一作文章。实验室将运用现有技术体系在包括恶性黑色素瘤及头颈部鳞癌等实体肿瘤中深入开展肿瘤恶性转化的演进机制,并探索肿瘤可塑性参与肿瘤转移和耐药分子机制研究。

因科研工作需要,现招聘博士后4名及科研助理2名,相关岗位研究方向,职责及应聘条件信息如下:

一、博士后 3名

研究方向1:生物信息学方向_癌前病变到恶性肿瘤的遗传学演进机制研究

(1)通过与临床医生合作搜集涉及到同一个病人中包含癌前病变到肿瘤的瘤组织,利用组织切片病理鉴定及显微切割技术,开展微量组织的外显子测序,表达谱测序及DNA甲基化分析;

(2)与加州大学旧金山分校Hunter Shain课题组(https://shainlab.ucsf.edu/)合作开展后续肿瘤演进的遗传学和表观遗传学分析;

(3)利用CRISPR/Cas9 Prime Editing等基因编辑技术向人原代正常细胞中逐步引入特定的病理性突变组合,结合类器官模型模拟正常细胞到肿瘤的演进路线,研究突变介导的肿瘤演进机制;

研究方向2:肿瘤细胞可塑性的产生机制和表型研究

(1)运用CRISPRa/i,基因剂量筛选等手段构建肿瘤细胞高通量基因剂量调控平台;

(2)探索基因突变和基因转录调控促进肿瘤细胞可塑性的协作机制;

(3)研究肿瘤细胞可塑性调控肿瘤侵袭转移及对分子靶向药物产生耐药的分子机制。

研究方向3: 基于病人特定突变和表达谱开展个性化靶点开发和临床用药策略研究

(1)与临床科室对接,挖掘肿瘤病人活检及手术组织的基因突变和表达谱特征;

(2)利用病人组织构建以组织类器官,PDC及PDX相结合的快速体外研究模型;

(3)结合老药库进行药敏测试和类器官/PDC的全基因组CRISPR筛选平台,开展治疗靶点和药物筛选,并快速推进个性化临床试验。

岗位职责:

(1)在导师指导下独立设计并开展课题研究;

(2)参与课题组实验平台建设;

(3)指导研究生开展实验;

(4)参与科研论文撰写;

(5)参与课题组基金申请,鼓励基于个人职业规划申请博士后基金。

应聘条件:

(1)在国内外获得博士学位原则上不超过三年,年龄在35周岁以下;

(2)有细胞生物学,生物化学,分子生物学,药理学等相关专业背景,有生物信息学背景者可优先考虑;

(3)以第一作者或通讯作者发表SCI论文1篇及以上,如论文在Revision中可同等考虑,申请时请附上证明材料,影响因子累计大于或等于5分者优先考虑;

(4)具有良好的中英文交流与读写能力;

(5)身心健康,工作诚信严谨,对科学有浓厚兴趣,待人宽和,具有良好的团队合作精神。

二、科研助理 2名 (含招聘一名生物信息学方向)

岗位职责:

(1)有能力领导小团队开展独立的课题研究(助理研究员/副研究员要求);

(2)维护实验室常用的仪器试剂和细胞系凭条,负责日常采购,维护实验室运转;

(3)收集归类临床组织,并进行原代细胞分离;

(3)参与科研项目和协助指导研究生课题研究;

(4)负责实验小鼠的饲养和维护;

(5)参与多个课题中涉及肿瘤生物信息学whole genome/exon/mRNA/scRNA-seq数据的生物信息学分析;

(6)协助实验室开展科研项目及指导研究生课题研究。

应聘条件:

(1)细胞生物学,生物化学,分子生物学,药理学等相关专业背景,具有博士或硕士学历,有生物信息学背景者优先考虑;

(2)熟悉通用分子生物学与细胞生物学技术;

(3)以第一作者或通讯作者身份发表过论文者优先;

(4)身心健康,热爱科研,工作认真投入,待人宽和,团队合作能力良好。

三、岗位待遇

博士后:基本生活费+考核奖励:税前 27-30 万/年。特别优秀者如申请并入选国家“博士后创新人才支持计划”、上海市“超级博士后”或医学院 “博士后激励计划”,年薪最高可达 38 万(税前)。考核优秀者可申报医学院副高级专业技术职务。特别优秀者,可破格申报医学院正高级专业技术职务。

提供科研启动经费 10 万/人,在站期间取得的科研成果按单位规定给予奖励。

科研人员:根据个人研究背景面议,提供有竞争力的薪酬和福利待遇。

四、招聘程序

本启事长期有效,招满为止。有意应聘者请提供详细个人简历,三位推荐人的联系方式,以及身份证、学历学位证书、相关资格证书和获奖证书等相关证明材料的电子版扫描件。申请材料发至:hrshipm@163.comshipm.hiring@outlook.com(请在应聘材料和邮件主题栏注明“应聘岗位+姓名+曾汉林肿瘤研究课题组”)。我们将根据收到的应聘材料进行初选与资格审查,并确定面试候选人员。由上海精准医学研究院组织院内外专家进行面试,确定拟聘人选。

联系人:秦老师

E-Mail地址:hrshipm@163.com
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yaqianye13楼
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