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zengjiarui

新虫 (初入文坛)

[求助] 诚心请教:两株菌的16S测序结果很相似,可以算是同一株菌吗?谢谢!已有4人参与

分离了一些肠球菌,27F和1492R引物对扩增测序后,发现它们的序列信息很相似,很多只在序列的首尾部分有一些不同碱基,请教一下它们会是同一株菌吗?非常感谢!
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zengjiarui

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by pansyg12 at 2021-01-08 16:47:36
不是可以把序列拿去NCBI里比对

已经在NCBI里比对过了,大概可以确认种属,只是不知道我得到的那几株菌,会不会其实是同一株?
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4楼2021-01-08 20:26:26
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pansyg12

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
不是可以把序列拿去NCBI里比对
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2楼2021-01-08 16:47:36
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嘟嘟熊levi

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
看你的实验目的,单单只是做一个鉴定,NCBI中去比对就好了,看得分和相似性。如果要是论文中的一部分数据,还要建树,还有其他的形态和生理生化鉴定。
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我凝望天涯,寻觅我的诗句
3楼2021-01-08 20:19:36
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zengjiarui

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 嘟嘟熊levi at 2021-01-08 20:19:36
看你的实验目的,单单只是做一个鉴定,NCBI中去比对就好了,看得分和相似性。如果要是论文中的一部分数据,还要建树,还有其他的形态和生理生化鉴定。

其实主要问题不是鉴定种属,而是想确认一下,分离得到的那几株菌,会不会其实是同一株?毕竟它们的16S序列很相似
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5楼2021-01-08 20:27:58
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