24小时热门版块排行榜     石溪大学接受考研调剂申请>

【调剂】北京石油化工学院2024年16个专业接受调剂
查看: 1267  |  回复: 7
【悬赏金币】回答本帖问题,作者珊瑚海super将赠送您 100 个金币

珊瑚海super

木虫 (著名写手)

[求助] 这种带箭头的基因图怎么做的?已有2人参与

请教,这种带箭头的基因图是如何画出来的?用PPT?还是有专门的软件一键出图?上面的箭头长短我知道应该是基因片段的长度,但是方向如何确定?有的向左有的向右,整个序列其实是一条基因,上面有很多别的基因片段,就是不知道这个方向是如何确定的,希望能遇见大神指点迷津。感谢

这种带箭头的基因图怎么做的?
1.png@wizardfan@biostar2009
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dingzhuang

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
序列软件 DNAstar 、 SnapGene 了解一下; 一个箭头表示一个ORF,箭头向左向右表示转录方向(同一基因簇中的不同ORF的转录是单独完成的,有的上链是正义链,有的下链是正义链)。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

实验!成果!文章!毕业!工作!
2楼2020-11-18 11:37:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

珊瑚海super

木虫 (著名写手)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by dingzhuang at 2020-11-18 11:37:42
序列软件 DNAstar 、 SnapGene 了解一下; 一个箭头表示一个ORF,箭头向左向右表示转录方向(同一基因簇中的不同ORF的转录是单独完成的,有的上链是正义链,有的下链是正义链)。

感谢,我现在是只有一窜测序后的基因序列,很长,如何知道这条链中不同的ORF的转录方向?
3楼2020-11-18 15:10:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jie123400

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
3楼: Originally posted by 珊瑚海super at 2020-11-18 15:10:52
感谢,我现在是只有一窜测序后的基因序列,很长,如何知道这条链中不同的ORF的转录方向?...

这个要自己来确定吧,有部分软件可以识别出一些常用的序列。未知序列得要自己来确认,然后在软件上进行标注。
4楼2020-11-18 16:35:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

珊瑚海super

木虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by jie123400 at 2020-11-18 16:35:42
这个要自己来确定吧,有部分软件可以识别出一些常用的序列。未知序列得要自己来确认,然后在软件上进行标注。...

非常感谢,那想知道未知序列的转录方向可以通过NCBI查看?还是....,现在有特定的方便查阅序列转录方向的网站或者软件吗?这些太深的东西我实在是刚接触,问的有点多
5楼2020-11-19 10:06:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

JY_Lee

新虫 (初入文坛)

如果已经有类似的序列的话可以做tblastn之类的进行比对,根据匹配情况就可以判断是正链还是复链,不然就只能靠一些软件做预测了

发自小木虫Android客户端

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

6楼2020-11-21 21:33:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

珊瑚海super

木虫 (著名写手)

送红花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by JY_Lee at 2020-11-21 21:33:07
如果已经有类似的序列的话可以做tblastn之类的进行比对,根据匹配情况就可以判断是正链还是复链,不然就只能靠一些软件做预测了

感谢回复,你是说拿现有的序列进行tblastn?,这样可以看出正反链是吗?
7楼2020-11-25 22:29:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

帕戴维

新虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by JY_Lee at 2020-11-21 21:33:07
如果已经有类似的序列的话可以做tblastn之类的进行比对,根据匹配情况就可以判断是正链还是复链,不然就只能靠一些软件做预测了

能否通过碱基序列判断,起始密码子和终止密码子

发自小木虫Android客户端
8楼2020-11-26 08:19:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 珊瑚海super 的主题更新
不应助 确定回帖应助 (注意:应助才可能被奖励,但不允许灌水,必须填写15个字符以上)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 真的好想读博! +10 wangzhe_bs 2024-04-22 13/650 2024-04-24 18:32 by 鱼翔浅底1
[考博] 求博导 +4 好okjh 2024-04-21 5/250 2024-04-24 18:18 by zxl_1105
[硕博家园] 考研,求职还是考编? +13 xizj 2024-04-21 21/1050 2024-04-24 17:23 by jxdic
[教师之家] 刚博士毕业,入职普通一本高校 +17 保持肌肤 2024-04-20 18/900 2024-04-24 16:01 by 款款飞
[基金申请] 化学结清有情发出来了 +3 starboy7286 2024-04-20 3/150 2024-04-24 15:52 by 嘿,黑贝
[考博] 博士招生 +4 zx179 2024-04-24 7/350 2024-04-24 15:01 by H考研成功
[考研] 0854-0855调剂 +6 shangannum1 2024-04-21 9/450 2024-04-24 14:43 by z_longlong
[考博] 申博成果界定是根据Jcr分区还是中科院分区 +4 我属驴核动力驴 2024-04-22 5/250 2024-04-24 08:47 by 晓目崇
[博后之家] 南京大学-广州大学联合招聘博士后 欢迎广大优秀人才!!! +4 黑魔变身啾 2024-04-20 10/500 2024-04-24 07:46 by dodonaomi
[论文投稿] 最近遇到这样一个问题 +4 asd123gfa689 2024-04-18 11/550 2024-04-23 20:14 by asd123gfa689
[教师之家] 发现督导在听课,需要跟TA招呼示意吗?有同学看手机、课件有疏漏算大问题吗? +11 河西夜郎 2024-04-19 11/550 2024-04-23 15:01 by mylifecg
[论文投稿] 编辑返稿让改格式,这个时候能大修内容吗? +6 双倍好运锦鲤 2024-04-17 9/450 2024-04-23 09:49 by fslaser
[考博] 研二光催化6月底4篇2区 +7 wjtab 2024-04-22 11/550 2024-04-23 06:59 by byron2012
[教师之家] 河海大学常州校区新进的讲师待遇如何?考核要求如何? +3 德国小球迷 2024-04-19 18/900 2024-04-22 19:23 by ZHONGWU_U
[考博] 青岛科技大学顾玉超教授课题组招收博士生 +3 yanqingwang 2024-04-19 3/150 2024-04-22 15:21 by 理科生yes
[考研] 问题已经解决。 +13 lekinna 2024-04-19 30/1500 2024-04-22 13:09 by 矛dei到
[论文投稿] 催稿后秒拒 +9 lizhengke06 2024-04-19 11/550 2024-04-21 22:29 by ggjjyyy
[基金申请] 估计今年青基又没戏 +11 忆念7 2024-04-18 11/550 2024-04-20 17:29 by mygod_nju
[考研] 考研英语带学 +6 choice666 2024-04-18 6/300 2024-04-19 17:46 by charles-c
[论文投稿] SCI 评审意见回复 模板 15+3 Kilig0317 2024-04-18 4/200 2024-04-19 08:46 by bobvan
信息提示
请填处理意见