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新虫 (小有名气)

[交流] 求转录组和微生物代谢相关方向的大牛交流

如题,通有没有做比较转录组来研究微生物的生物合成基因簇表达情况的大牛,或者只是研究微生物转录组的大牛啊?求交流!

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eaplex

新虫 (初入文坛)


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有什么特别的需求或疑惑吗?

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2楼2020-07-01 00:51:59
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15757175070

新虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by eaplex at 2020-07-01 00:51:59
有什么特别的需求或疑惑吗?

你好,我之前没有接触过转录组,现在想通过转录组分析,确定不同培养条件下微生物哪些生物合成基因簇表达了,哪些没有表达?我的实验应该怎样设计呢?假设我得到了微生物的总RNA,然后进行RNA测序,测序以后如何判断哪些是微生物产次级代谢产物的基因?如何判断基因是否表达?表达的量有多少等等?有没有相关的生信分析软件或者参考文献?求指导!

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3楼2020-07-02 10:19:40
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