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【调剂】北京石油化工学院2024年16个专业接受调剂
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北城_别

铜虫 (小有名气)

[求助] 怎样用forcite画(分子间)!径向分布函数

看别人文献里径向分布函数的横坐标r的单位为nm,而在MS8.0中的forcite的RDF的横坐标却是A,而且最大只能设置到1000A(10负三次方nm)这明显是不对的,请问各位前辈,文献里是怎样处理得到的?还有就是,我是直接手选的分子链,然后设置为set,请问这样对么?是不是还要进行质心的设定?请前辈赐教!

怎样用forcite画(分子间)!径向分布函数
他人文献g(r).png


怎样用forcite画(分子间)!径向分布函数-1
我用MS算的g(r).png


怎样用forcite画(分子间)!径向分布函数-2
我的sets设定.png
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117zhanglei

新虫 (正式写手)

2楼2020-06-01 23:15:52
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117zhanglei

新虫 (正式写手)

3楼2020-06-01 23:16:16
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北城_别

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 117zhanglei at 2020-06-01 23:15:52
距离单位换算理解有误

那请问为什么我的径向分布函数 那么的不平滑?
4楼2020-06-02 00:36:27
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dmpbyidong

铜虫 (正式写手)


引用回帖:
4楼: Originally posted by 北城_别 at 2020-06-02 00:36:27
那请问为什么我的径向分布函数 那么的不平滑?...

因为看到的文献都是经过别人处理过的 看着平滑  是因为用到了拟合曲线

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5楼2020-06-02 08:20:23
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傲傲的

新虫 (著名写手)

这个A是埃,具体你可以百度学习,rdf中set建立很有说法的,最好你可以发邮件请教一下,一般直接建立set分析效果都不是很好

发自小木虫IOS客户端
6楼2020-06-03 15:52:43
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1430588906

新虫 (小有名气)

求助求助,RDF怎么做A分子为中心,周围其他分子的径向分布情况?怎么设质心呢

发自小木虫Android客户端
7楼2020-10-30 10:49:40
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lhyaya

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 1430588906 at 2020-10-30 10:49:40
求助求助,RDF怎么做A分子为中心,周围其他分子的径向分布情况?怎么设质心呢

请问解决了吗,我也是这个地方不太懂

发自小木虫Android客户端
8楼2021-03-16 21:42:40
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