【调剂】北京石油化工学院2024年16个专业接受调剂
查看: 2653  |  回复: 2
【悬赏金币】回答本帖问题,作者喵帕斯儿将赠送您 20 个金币
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

喵帕斯儿

新虫 (小有名气)

[求助] 使用msi2lmp工具,lammps的data文件中molecule-ID无法正确生成的问题

如题,我是做水合物模拟方向的,使用material studio建好模型后,使用cvff力场run后,导出car文件,然后使用msi2lmp工具转化为lammps的data文件,然后发现第二列(即molecule-id)不正确,如图1所示。然而别人的data文件中,o h h三个原子为一组(一个水分子),编号整齐,如图2所示。想问下诸位,如何才能实现这样的效果,是material studio中不支持正确的分子编号?还是我使用msi2lmp工具有误?还是说需要后期编脚本自行修改?

使用msi2lmp工具,lammps的data文件中molecule-ID无法正确生成的问题
1(我生成的data文件).jpg


使用msi2lmp工具,lammps的data文件中molecule-ID无法正确生成的问题-1
2(正确的格式).jpg
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 喵帕斯儿 的主题更新
不应助 确定回帖应助 (注意:应助才可能被奖励,但不允许灌水,必须填写15个字符以上)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 发个文章,结果被某学报请的外审PUA了 +3 ziniu168 2024-04-18 8/400 2024-04-18 21:40 by xli1984
[考研] 298求调剂 +7 孙大大@ 2024-04-17 7/350 2024-04-18 19:43 by lature00
[论文投稿] 国家重点研发计划论文可以发MDPI里的期刊吗 +3 lin_2018 2024-04-17 3/150 2024-04-18 17:01 by topedit
[考研] 275求调剂 +8 调剂0856 2024-04-14 10/500 2024-04-17 23:23 by 华北刘兵
[考研] 345 求调剂 +5 南风轻语5 2024-04-12 7/350 2024-04-17 07:58 by 机械考研学生
[考博] 24计算机申博 +4 学无止境er 2024-04-13 6/300 2024-04-16 19:15 by 学无止境er
[考博] 25年申博求助,射频方向 +4 SherlockAH 2024-04-15 10/500 2024-04-16 18:06 by ljysudaee
[考研] 294求调剂 +3 694062003 2024-04-15 4/200 2024-04-16 15:01 by 邹邹哈哈
[考研] 312求调剂 +3 Lauhalo 2024-04-15 3/150 2024-04-16 10:16 by 19862091
[考研] 食品工程考数学283还能有什么调剂选择 +7 宇宙无敌美少女 2024-04-12 8/400 2024-04-16 10:11 by cyclodextrin726
[考研] 296求调剂 +3 Cclocomotive 2024-04-16 4/200 2024-04-16 10:04 by 19862091
[论文投稿] with efitor 越久是不是越容易拒稿。我的已经一个多月了 +5 lizhengke06 2024-04-14 5/250 2024-04-15 18:33 by jonewore
[考研] 化学、材料类最后调剂机会!!! +3 加油努力就好 2024-04-14 10/500 2024-04-15 09:05 by 任pen
[考研] 300求调剂 +5 @Xqy668800 2024-04-14 6/300 2024-04-14 23:03 by lincunhui
[考研] 一志愿中国科学院大学生物与医药专业,总分332,求调剂。 +4 2114020553 2024-04-13 4/200 2024-04-13 17:21 by lincunhui
[考研] 339求调剂 +9 材料调剂111 2024-04-12 10/500 2024-04-13 17:07 by lincunhui
[考研] 314求调剂 +18 阿洛法 2024-04-12 20/1000 2024-04-13 13:40 by kxxmaqq
[考研] 335求调剂 +7 Wzp123456. 2024-04-12 7/350 2024-04-13 09:34 by haomaier
[考研] 化工专硕求调剂 +9 青梅duoduo 2024-04-12 11/550 2024-04-13 09:33 by lincunhui
[考研] 275求调剂 +6 南幕星辰 2024-04-12 6/300 2024-04-12 18:56 by qikanlunwen
信息提示
请填处理意见