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【调剂】北京石油化工学院2024年16个专业接受调剂
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mywk1123

新虫 (小有名气)

[交流] 求助已有3人参与

想请问一下，（以厌氧氨氧化菌为例）大部分的文献都是只给了进化树，而没有给类似于图中这样的每个属所占的百分比，我在文章中从哪里能统计到类似于这样的百分比呢？

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1楼2020-03-29 11:23:21
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mywk1123

新虫 (小有名气)
求助-1

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2楼2020-03-29 11:23:55
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virty76

铁杆木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
应该是相关核酸丰度吧
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3楼2020-03-29 13:45:54
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mywk1123

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by virty76 at 2020-03-29 13:45:54
应该是相关核酸丰度吧

那如果文章中没有写出来的话，我能不能找到呢

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4楼2020-03-29 15:52:47
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mywk1123

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by virty76 at 2020-03-29 13:45:54
应该是相关核酸丰度吧

您能看到这个图吗
求助-2



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5楼2020-03-29 15:53:10
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jimmyji

铁虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by mywk1123 at 2020-03-29 15:53:10
您能看到这个图吗

...

这应该是16S的样本数据吧。一般16s数据分析后可以得到样本中所有的OTU序列信息。文章选的dominant OTUs一般认为是相对序列丰度＞一定值（例如1%）的序列来研究。如果文章中没有给出anammox 具体OTUs的相对丰度（可能是作者没分析），你可以看文章有没有给出16s数据上传的NCBI等文库编号，一般都会有一个对应标号让读者去网上文库下载原始16s数据。有编号的话就去下载相应数据，然后自己通过mothur或者Qiime2进行数据处理，就可以得到对应OTU的相对丰度。
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6楼2020-04-28 13:28:04
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2018sherry

新虫 (著名写手)
请问，进化树中的参考序列如何确定

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7楼2020-05-13 00:22:49
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