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【调剂】北京石油化工学院2024年16个专业接受调剂
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落日余晖34

木虫 (正式写手)

[求助] 毕赤酵母GS115电转pPICZαA-目的基因已有1人参与

楼主最近在做毕赤酵母GS115电转pPICZαA-目的基因,但是并未得到整合子。以下是我的步骤
1.毕赤酵母感受态的制备
(1)从YPD 平板上挑取毕赤酵母GS115单菌落至10 mL YPD培养基中,30 °C、200 r•min-1培养24 h;
(2)按1%  的接种量转接至装有50 mL YPD培养基中,30 °C、200 r•min-1培养约8 h(OD600=1.3-1.5)左右(测定有1.8),置于冰上冷却30min左右;
(3)将全部菌液转移至预冷的10 mL EP管中(分4管收集菌体), 4 °C、4,000 r•min-1 离心5 min;
(4)弃上清,加入8 mL预冷的无菌水,将菌体沉淀轻轻吹吸均匀,冰上静置5min,4 °C、4,000 r•min-1离心3 min,弃上清,重复1次上述操作。
(5)参照(4)中的方法用8mL预冷的1 mol•L-1的山梨醇洗涤菌体3次。
(6)向EP管中加入500μL 1 mol•L-1的山梨醇重新悬浮菌体(每管加500μL),按每管100 μL的量分装于预冷的无菌的1.5 mL 离心管中,即获得毕赤酵母GS115感受态细胞。由于时间原因,做好的感受态在电转前暂存于-80度,大概放置了有1天的样子。
2.重组质粒的转化
(1)将经过SacI线性化的pPICZαA-EKL质粒DNA进行纯化回收(我切了有10μg质粒,线性化之后,,采用30μL无菌水,进行洗涤柱回收,最后烘干浓缩到10μL左右);
(2)向毕赤酵母GS115感受态细胞中加入10 μL(5-10µg)线性化的质粒,轻轻吹吸混匀,冰浴静置5 min,
(3)将上述全部菌液转移至预冷的0.2 cm的电转杯中,1500 V,5 ms电击1次;
(4)电击完毕后立刻向电转杯中加入1 mL 1 mol•L-1的山梨醇,将菌液吹吸混匀,转移至已灭菌的1.5 mL EP管中,于30 °C恒温培养箱中培养1 h;
(5)3,000 r•min-1离心2 min,收集菌体取涂于含有Zeocin 100µg/ml的YPDS平板培养基上(大概重悬后有200μL,全部涂于一个平板上),30 °C恒温培养2~3天,直到有单菌落长出。
问题:1.没有得到重组整合子的原因,是不是分四管收集菌体,最后洗涤完之后每管加500μL,导致最后的菌浓稀释了?
          2.询问师姐得知线性化的质粒还是少了?10μg是否足够呢?
          3.由于是当天新倒的平板,涂板的有些湿,先正放等表面水干了,第二天再倒置培养,平板的湿度是否有影响呢?
求做过这方面的虫友看看哪里有问题呢?
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有时候总要努力下
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zouyoutu

木虫 (正式写手)

可可

1:GS115电转的感受态必须很浓稠,200uL移液枪不太好吸得那种感觉最好。
2: 10ug重组质粒线性化后,用洗涤柱回收,有再测浓度吗?手册上写电转时要有10ug的线性化的重组质粒,实际操作至少也要有5ug以上。(我的经验是10ug转,感受态可以稀一点,5ug转的话,感受态就要很浓稠,参考第1点)。
3:电转后,孵育的时间不够,我记得手册上写在电转后,先冰育,然后再加入几ml山梨醇在30度孵育2小时,然后再加入培养基30度继续孵育1小时。因为你是用zeocin抗性,电转后要是没有孵育好,感受态没有回复正常,就算转进去了,也不容易在有抗性的的平皿上生长。如果你用组氨酸缺陷筛选,就不需要孵育这么久,甚至不需要孵育。
14楼2021-04-08 16:58:16
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雪色残洋

铜虫 (小有名气)

我也做了pPICZαA-目的基因,表达载体和目的基因做了两次酶连以制备单克隆了,目前不知道啥原因就是不长菌。
不知道是感受态不行还是没转化进感受态,亦或是连接不成功?
5楼2020-03-19 08:24:20
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zouyoutu

木虫 (正式写手)

可可

4:还有就是Zeocin浓度 50μg/ml时,转化子会多一些。 100μg/ml也行,但转化子会少。现在你没有转化子出现,建议 50μg/ml和100μg/ml各做一板。
15楼2021-04-08 17:02:47
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落日余晖34

木虫 (正式写手)

有时候总要努力下
2楼2020-03-15 10:21:52
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落日余晖34

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 落日余晖34 at 2020-03-15 10:21:52

电转完以后如上图所示,有白色的斑点,有两个我疑似的,但是跟正常的115长的不一样……

发自小木虫IOS客户端
有时候总要努力下
3楼2020-03-15 10:24:16
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biosci

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这些都不是,正常毕赤酵母菌落不是这样的

发自小木虫Android客户端
4楼2020-03-18 10:34:08
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落日余晖34

木虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 雪色残洋 at 2020-03-19 08:24:20
我也做了pPICZαA-目的基因,表达载体和目的基因做了两次酶连以制备单克隆了,目前不知道啥原因就是不长菌。
不知道是感受态不行还是没转化进感受态,亦或是连接不成功?

连接不成功的话可以考虑无缝克隆连接

发自小木虫IOS客户端
有时候总要努力下
6楼2020-03-22 08:15:27
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ggdy3478

银虫 (小有名气)

估计感受态要新做的马上转,你现在看到的都是阴性菌

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
青椒一个
7楼2020-03-24 21:40:35
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落日余晖34

木虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by ggdy3478 at 2020-03-24 21:40:35
估计感受态要新做的马上转,你现在看到的都是阴性菌

培养了大概3天多长出来的,但是后面接摇瓶,添加抗性,也能生长这就很奇怪了。

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8楼2020-03-24 23:03:22
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ggdy3478

银虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 落日余晖34 at 2020-03-24 23:03:22
培养了大概3天多长出来的,但是后面接摇瓶,添加抗性,也能生长这就很奇怪了。
...

那就提取菌体DNA PCR验证一下
青椒一个
9楼2020-03-25 10:12:36
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落日余晖34

木虫 (正式写手)

引用回帖:
9楼: Originally posted by ggdy3478 at 2020-03-25 10:12:36
那就提取菌体DNA PCR验证一下...

昨天跑了蛋白胶,今天看了下图,虽然在理论大小附近有条带,但是上清蛋白太低了……浓缩10倍左右才能看到,而且拖尾现象明显,哎

发自小木虫IOS客户端
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10楼2020-03-25 23:27:10
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