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【调剂】北京石油化工学院2024年16个专业接受调剂
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whichme

新虫 (初入文坛)


[交流] 重叠PCR,屡次失败,求助大神们

最近在做重叠pcr,片段A(409bp)、B(1777bp),目的片段为2100多bp。我的做法是,第一轮用引物对E\F扩增出A、R\T扩增出B、胶回收,引物F和R有26bp重叠,重叠部分Tm59℃。第二轮用片段A和B为模版,不加引物扩增5循环,然后用加引物E和T扩增25循环。(10ul体系:酶5ul;片段A 15ng;片段B 45ng;引物E\T 各0.5ul;水补到10ul)(反应条件:94℃ 2min;98℃ 10s,58℃ 5s,72℃ 40s;72℃ 2min)5和25循环条件都是如此,用的是塔克拉的快速高保真酶。但是总是没有目标条带,而在600bp位置出现非特异条带,而且条带非常的亮。退火温度也换过53℃,55℃,60℃,结果都是一样。大伙觉得我这是哪里出了问题,有没有好的解决办法呢?
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whichme

新虫 (初入文坛)


引用回帖:
3楼: Originally posted by 金书豆豆 at 2019-11-12 18:10:04
你用A和B为模版,引物E/T扩增 试试

试过了,不行,每次只出现非特异条带
6楼2019-11-13 17:25:00
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JAYWEN书生

银虫 (小有名气)


Proofast™ Super-Fidelity DNA Polymerase
还不错,我师姐在Science Advances发的文章就用这个。DOI: 10.1126/sciadv.aaw8451
10楼2020-03-11 15:16:36
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普通回帖

wardwaads

银虫 (小有名气)



whichme(金币+1): 谢谢参与
为什么用重叠PCR 呢?直接扩增目的片段不行吗

发自小木虫IOS客户端
2楼2019-11-11 18:26:43
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金书豆豆

木虫 (小有名气)



whichme(金币+1): 谢谢参与
你用A和B为模版,引物E/T扩增 试试
3楼2019-11-12 18:10:04
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slcat

新虫 (著名写手)



whichme(金币+1): 谢谢参与
一是可以重新设计引物,增加A、B片段的重叠部分长度;二是可以用SLIC直接将AB整合到某个质粒上,以后直接用该质粒做模板,不必重复做overlap PCR

发自小木虫Android客户端
8楼2019-11-15 15:33:37
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Explor

新虫 (正式写手)



whichme(金币+1): 谢谢参与
如果你的PCR试剂盒用得不好,推荐BIOGHSC试剂盒,效果不错的。
9楼2019-11-18 09:09:18
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Worlddove

新虫 (初入文坛)



whichme(金币+1): 谢谢参与
楼主问题解决了吗,我现在也是这样的问题

发自小木虫Android客户端
13楼2022-07-10 17:45:48
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766482434

禁言 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
本帖内容被屏蔽

15楼2022-08-22 16:32:42
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skk910416

铜虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
重叠部分用40bp试试,然后直接a,b当模板,两端引物直接30个循环,一般问题不大

发自小木虫Android客户端
16楼2022-08-27 21:27:56
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简单回复
psylhh4楼
2019-11-12 22:42   回复  
whichme(金币+1): 谢谢参与
2019-11-13 15:31   回复  
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tzynew7楼
2019-11-14 07:00   回复  
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nono200911楼
2021-10-03 14:43   回复  
whichme(金币+1): 谢谢参与
·
2021-10-04 21:52   回复  
bjdxyxy14楼
2022-07-10 18:31   回复  
whichme(金币+1): 谢谢参与
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