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Cherishqj

铜虫 (小有名气)

[求助] 为什么模拟出来的蛋白三维结构残基不全

通过一个在线网站模拟了蛋白三维结构，没有进行优化（我不会啊，求教），之后用Pymol可视化，发现该蛋白不是从第一个氨基酸开始的，头尾都有缺失，为什么会这样啊

为什么模拟出来的蛋白三维结构残基不全
360截图16251121113143137.png
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1楼2019-11-07 11:26:03
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Cherishqj

铜虫 (小有名气)
如图，蛋白质是从第5个氨基酸开始的，后面也缺了100多个
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2楼2019-11-07 11:27:15
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longdlut

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最好用modeller建模，在线网站很多会丢失氨基酸残基

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3楼2019-11-08 07:30:47
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Cherishqj

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by longdlut at 2019-11-08 07:30:47
最好用modeller建模，在线网站很多会丢失氨基酸残基

这个软件要用到脚本、代码什么的，对我来说太难了
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4楼2019-11-11 11:22:19
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longdlut

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会的话更好，不会的话也可以实现

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5楼2019-11-11 11:28:42
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Cherishqj

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by longdlut at 2019-11-11 11:28:42
会的话更好，不会的话也可以实现

您好，我之前用的方法是单个模板建模，所以结构不完整，之后查阅了一些资料，采用多模板建模，这样的最后的三维结构残基是完整的，但是结构有很多断开的地方，是一截一截的，请问这个可以优化吗
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6楼2019-11-11 11:35:16
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longdlut

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断开是什么意思，私信看一下

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7楼2019-11-11 12:51:48
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lsj10181

金虫 (正式写手)
详细看看山大的生物信息学，国家精品课程有视频

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8楼2019-11-30 09:28:44
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