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【调剂】北京石油化工学院2024年16个专业接受调剂
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乐奏球

新虫 (著名写手)


已领完
径向分布函数归一化
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请问大家,用LAMMPS或者VMD计算的径向分布函数怎么才能得到归一化的呢?下面是我用VMD做的图,可是最后都没有归一化

径向分布函数归一化


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发条鸟1

铁虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
9楼: Originally posted by 乐奏球 at 2019-10-13 20:33:16
谢谢,请问总值是最后不变时纵坐标对应的值吗?我开始是这么想的可是不敢确定
...

楼主最后如何归一化的?我也遇到同样的问题
53楼2020-05-20 14:02:40
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aa小小佑

银虫 (职业作家)


每个值除以总和

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» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2019-10-13 20:30:39
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乐奏球

新虫 (著名写手)


送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by aa小小佑 at 2019-10-13 20:30:39
每个值除以总和

谢谢,请问总值是最后不变时纵坐标对应的值吗?我开始是这么想的可是不敢确定

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9楼2019-10-13 20:33:16
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aa小小佑

银虫 (职业作家)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
9楼: Originally posted by 乐奏球 at 2019-10-13 20:33:16
谢谢,请问总值是最后不变时纵坐标对应的值吗?我开始是这么想的可是不敢确定
...

是所有值加起来,然后每个值除以总和,就是归一化了

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» 本帖已获得的红花(最新10朵)

15楼2019-10-13 20:53:42
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乐奏球

新虫 (著名写手)


送红花一朵
引用回帖:
15楼: Originally posted by aa小小佑 at 2019-10-13 20:53:42
是所有值加起来,然后每个值除以总和,就是归一化了
...

好的谢谢,我试试

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18楼2019-10-13 21:03:26
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工299

新虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
请问你是怎么用LAMMPS求的径向函数啊,我用DFTB不知道怎么求

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47楼2019-10-23 16:16:56
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Lzw@

新虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
我想问一下,你计算径向分布函数是计算某一时刻还是某一时间段的?

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48楼2019-11-14 10:27:08
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美腻小姐姐

新虫 (正式写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
47楼: Originally posted by 工299 at 2019-10-23 16:16:56
请问你是怎么用LAMMPS求的径向函数啊,我用DFTB不知道怎么求

数据导进VMD中,就有选项可以直接导出径向分布函数,如果你还没有解决的话,可以加我QQ1462115880.关于如何通过VMD得出径向分布函数这个我做过。

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49楼2019-12-08 23:02:38
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18821677827

金虫 (正式写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
49楼: Originally posted by 美腻小姐姐 at 2019-12-08 23:02:38
数据导进VMD中,就有选项可以直接导出径向分布函数,如果你还没有解决的话,可以加我QQ1462115880.关于如何通过VMD得出径向分布函数这个我做过。
...

你好,径向分布函数用lammps 算出数据后,数据后处理是怎么处理啊,我这刚做不太懂,能请教下吗?

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50楼2019-12-24 23:12:39
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美腻小姐姐

新虫 (正式写手)


引用回帖:
50楼: Originally posted by 18821677827 at 2019-12-24 23:12:39
你好,径向分布函数用lammps 算出数据后,数据后处理是怎么处理啊,我这刚做不太懂,能请教下吗?
...

那你会用VMD吗

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51楼2019-12-25 09:02:15
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18821677827

金虫 (正式写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
51楼: Originally posted by 美腻小姐姐 at 2019-12-25 09:02:15
那你会用VMD吗
...

会一点点,就是看看轨迹文件,输出图片

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52楼2019-12-25 18:06:09
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发条鸟1

铁虫 (小有名气)


楼主最后怎么做的呢?我也遇到这个问题
54楼2020-05-20 14:03:35
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2019-10-13 20:29   回复  
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2019-10-13 20:30   回复  
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2019-10-13 20:31   回复  
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tzynew6楼
2019-10-13 20:31   回复  
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Maojiashu7楼
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伏地魔10楼
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dzxylxm12楼
2019-10-13 20:38   回复  
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S-Loser44楼
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