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【调剂】北京石油化工学院2024年16个专业接受调剂
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狂暴小子

新虫 (正式写手)

[求助] 细菌菌落数与拷贝数是否对等？已有3人参与

本人在做荧光PCR检测菌数量的实验，通过qPCR检测出这个菌在这个环境中有2.49*10^8Copies/ul，然后又作了活菌计数作对照，活菌计数的值为1.38*10^9CFU/mL。
我想问各位虫友的是，通过这个数据，能看的处qPCR检测出的量是否大于活菌计数，或者说两个值是否对等？还有就是拷贝数与菌落数是否对等呢？他们之间换算的单位是什么呢？
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1楼2019-09-17 19:45:33
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1272356152

新虫 (正式写手)
没有换算单位

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2楼2019-09-17 20:08:57
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biosci

捐助贵宾 (职业作家)
qpcr不准的

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3楼2019-09-17 22:18:52
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wadecao

禁虫 (正式写手)
★ ★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2019-09-29 22:32:11
本帖内容被屏蔽
4楼2019-09-17 22:55:24
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狂暴小子

新虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by wadecao at 2019-09-17 22:55:24
如果你选择的检测位点在细菌里面是单拷贝那就是一一对应的。数据上面出现偏差，主要是两种方法通过稀释来检测会出现误差，放大之后就会很明显。

那我想问一下，我到底是以哪个为标准呢，因为我要做这个菌的定量分析，所以用的是qpcr，可是我看了很多文献，几乎都是只看这个菌在整个时期的一个变化趋势，还有一些文献虽然具体说明了数量，但是说的特别含糊。虽然我拿这个活菌计数进行对比，但是却不知道到底是pcr定的量是准的还是活菌计数是准的

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5楼2019-09-17 23:03:30
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wadecao

禁虫 (正式写手)
本帖内容被屏蔽
6楼2019-09-17 23:22:39
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xipha

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2019-09-29 22:32:40
PCR不管死活，活菌计数采样量小。两种都有缺点，两种都有假阳性计数。各有各的方便。用不同的方法测量同一个物理量会引入不同的系统误差。具体哪个好，关键是看你要讨论的科学问题对计数的要求。
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7楼2019-09-29 11:25:02
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西早小小姐

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by wadecao at 2019-09-17 22:55:24
如果你选择的检测位点在细菌里面是单拷贝那就是一一对应的。数据上面出现偏差，主要是两种方法通过稀释来检测会出现误差，放大之后就会很明显。

老师，您好。学生面临同样困惑，可以私下向您请教吗？QQ号：1348209876。非常感谢

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8楼2020-03-17 11:43:36
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dytloveyou

新虫 (初入文坛)
您好楼主，我是小白一枚。最近导师让我用qpcr检测发酵茶叶样本中的总细菌拷贝数。我什么都不懂，您能教我一下吗？某师兄跟我简单说了一下，先找到细菌16s基因组？合成质粒，然后做标曲，再提环境样本dna做荧光pcr。这个16s基因组在哪里获取呀，选择多长呢，是否要连接载体？然后可以用通用引物吗？

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9楼2020-06-09 18:47:18
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