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系统发育树构建时遇到的问题
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想问大家个问题，最近对筛菌得到的32个真菌ITS序列（编号为MEFC）在NCBI上进行blast比对，然后选取相似度较高的序列，并下载其fasta格式的序列。然后直接用MEGA7构建系统发育树。却发现MEFC009,MEFC077,MEFC082,MEFC050等并没有与其相似度高的物种聚在一起，而是单独分开（如下图）。请问：这是什么原因造成的呢？是选取序列时有误吗？还是在构建系统发育树的过程中有误呢？ 想问下大家有遇到这种问题的吗，是怎么解决的呢？  发自小木虫Android客户端 |
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