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颜小丽

新虫 (小有名气)

[求助] 系统发育树

各位老师,想请问一下
我筛选出的菌拿去测序,得出的结果经过BLAST比对后,想要绘制系统发育树,下面是我绘制的图,下面的是我选的blast结果出来后,选的99% 的,上面是我在NCBI上选的同一属的菌种,想问一下怎么绘制的图是这样的?如何提高下面节点的数值?或者说到底要怎么选择序列呢?谢谢,我已经研究了好几天了,没太弄懂

系统发育树


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ZYL守候BUS

金虫 (正式写手)

★ ★ ★
小冀-: 金币+3, 鼓励回帖交流 2019-05-31 13:52:22
如果想通过进化树增强序列之间的同源性,可以把其中同源性院的序列剔除掉或者更换其他序列,这个方法可以试试,希望对你有帮助,不过这个是人为剔除序列,只是想让进化树看起来好看

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2楼2019-05-31 12:09:14
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颜小丽

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by ZYL守候BUS at 2019-05-31 12:09:14
如果想通过进化树增强序列之间的同源性,可以把其中同源性院的序列剔除掉或者更换其他序列,这个方法可以试试,希望对你有帮助,不过这个是人为剔除序列,只是想让进化树看起来好看
...

我有剔除前面和后面的序列,就是“掐头去尾”,中间部分的没有去除。觉得去除了,那个值就更小了,想问一下,怎么去找合适的序列

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3楼2019-05-31 14:59:11
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