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m6A RNA甲基化文章套路
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m6A RNA甲基化文章套路 --生信自学网光俊 关于m6A甲基化的研究热度持续不减。那么,究竟什么是m6A? 如何通过数据库挖掘m6A? 肿瘤挖掘m6A整体研究思路如何? 生信自学网最新的m6A课程，根据5分多的文章进行讲解。通过从TCGA数据库下载，然后提取m6A相关基因的表达量，并找出具有表达差异m6A基因。接下来，我们使用m6A基因对肿瘤进行分型，得到肿瘤subtype，并使用PCA方法验证分型的准确性。最后，我们使用m6A相关基因构建生存模型，通过m6A基因的表达量，预测病人的生存期。 RNA修饰是一种转录后水平的调控方式，目前已鉴定到超过150种RNA修饰，它们广泛分布于各类 RNA，如信使 RNA (mRNA)、 转运RNA(tRNA)、核糖体RNA (rRNA)、非编码小 RNA (sncRNA)和长链非编码 RNA (lncRNA) 。 RNA甲基化修饰约占所有RNA修饰的60%以上，而m6A(6-甲基腺嘌呤)是高等生物mRNA上最为常见的一类RNA甲基化修饰。转录本m6A的修饰水平受甲基转移酶(编码器)、结合蛋白(读码器)和去甲基化酶(消码器)的动态调控。 甲基转移酶(编码器) ： KIAA1429, METTL3 , METTL14 , RBM15 , WTAP , ZC3H13 结合蛋白(读码器) ： HNRNPC , YTHDC1 , YTHDC2 , YTHDF1 , YTHDF2 去甲基化酶(消码器) ： ALKBH5 , FTO 购买链接1： https://item.taobao.com/item.htm?spm=a230r.1.14.11.93291e30ZVKgWj&id=594935342950&ns=1&abbucket=13#detail 购买链接2： http://www.biowolf.cn/shop/biovideo-219.html  01.JPG  02.JPG  03.png  04.png  05.png  06.JPG  07.JPG  08.JPG  09.png  10.JPG  11.JPG  12.png  13.JPG  14.JPG |
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