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【调剂】北京石油化工学院2024年16个专业接受调剂
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0010030335

金虫 (小有名气)

[求助] 乳腺癌21基因复发评分值已有1人参与

各位大神,请问谁知道文章中所描述的基因表达的标准化是如何计算的?为什么标准化后的值在0-15之间?感谢。

The recurrence score on a scale from 0 to 100 is derived from the referencenormalized expression measurements in four steps.

First, expression for each gene is normalized relative to the expression of the five reference genes (ACTB[the gene encoding  b -actin], GAPDH, GUS, RPLP , and  TFRC). Reference-normalized expression measurements range from 0 to 15, with a 1-unit increase reflecting approximately a doubling of RNA.
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追梦小安

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
弄明白没?我最近也在纠结,试了好多结果和一些报告不一致。0-15可能是线性归一到(0,15)
2楼2019-05-16 20:59:30
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0010030335

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 追梦小安 at 2019-05-16 20:59:30
弄明白没?我最近也在纠结,试了好多结果和一些报告不一致。0-15可能是线性归一到(0,15)

还没弄明白。怎么归一到0-15呢?我看了相关文献,有的直接用内参基因的平均Ct值-其余每个基因的平均Ct值。还有别的计算公式。但是都算不明白。

发自小木虫Android客户端
3楼2019-05-17 07:52:29
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追梦小安

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 0010030335 at 2019-05-17 07:52:29
还没弄明白。怎么归一到0-15呢?我看了相关文献,有的直接用内参基因的平均Ct值-其余每个基因的平均Ct值。还有别的计算公式。但是都算不明白。
...

线性归一试试(x-min)/(max -min) *15可以吗?

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4楼2019-05-17 12:47:41
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0010030335

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 追梦小安 at 2019-05-17 12:47:41
线性归一试试(x-min)/(max -min) *15可以吗?
...

with a 1-unit increase reflecting approximately a doubling of RNA.那这句怎么理解呢?感谢。

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5楼2019-05-17 13:02:25
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追梦小安

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 0010030335 at 2019-05-17 13:02:25
with a 1-unit increase reflecting approximately a doubling of RNA.那这句怎么理解呢?感谢。
...

我也不太理解,我查了rtpcr数据分析的时候,都有2的负指数分析,你可以搜下看看是不是相关

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6楼2019-05-17 13:24:19
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0010030335

金虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 追梦小安 at 2019-05-17 13:24:19
我也不太理解,我查了rtpcr数据分析的时候,都有2的负指数分析,你可以搜下看看是不是相关
...

方便加qq或者微信吗?

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7楼2019-05-17 14:01:46
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