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高斯扫描
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各位大神，麻烦帮忙看下，最近做了一个高斯扫描，想产生一个过渡态初猜，但是结果显示从反应物到产物能量一直下降，并没有期望的最高点，下面是输入输出文件。感激不尽~ 1.jpg |
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2019-04-24 21:06:41, 12.6 M
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paramecium86
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| 预设的过渡态是什么样子的呢？ 我个人的感觉来看，从文件来看 这个扫描就是模拟两个部分相互接近成键的过程。这种两个部分相互接近成键过程 很可能就没有过渡态 或者过渡态那里的势能曲线特别平缓。这个过程可以类比最理想状态 把两个原子从无穷远逐渐接近到成键 的势能曲线就是逐渐降低。在成键的平衡位置达到最低 之后再接近就再升高。是没有过渡态的。 一般形成过渡态都存在着旧键断裂新键生成的过程。旧键断裂占主导的时候 能量曲线升高 新键生成占主导能量曲线降低。旧键要断没断 新键要生成还没生成时候 两种作用达到平衡 是过渡态。这个scan的过程 是破坏了一个环上的共轭结构 生成了一个c-c键。 破坏共轭的能量升高作用 远远小于 生成c-c键能量的降低的，这个角度来看过渡态不太明显也很合理。 另外在扫描曲线 3.3 附近那个点 像一个顶点 可以试试把扫描步长调小看看能不能更明显看到顶点。 |
2楼2019-04-25 00:55:54
3楼2019-04-25 08:46:37
4楼2019-04-25 08:46:41
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