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huanyuezhi

银虫 (小有名气)

[交流] 问一个很基本的问题，分子动力学和统计力学的区别以及径向分布函数所属的学科

最近小弟在看一些关于径向分布函数的内容，对其所属的学科有些疑惑。看网上有些地方说是分子动力学中的（Molecular dynamics），而维基百科和百度百科却说是统计力学中的（Statistical mechanics ）。小弟对这个领域不是很了解，想知道分子动力学和统计力学有什么关系？个人理解是统计力学是分子动力学的基础，不知道对不对？ 另外，想在文章中介绍径向分布函数的来源，究竟是说来自分子动力学好还是统计力学好呀？谢谢大家了！
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1楼2019-03-26 17:21:28
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DorothyMao

金虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
huanyuezhi(金币+1): 谢谢参与
月只蓝: 金币+10, 感谢交流 2019-03-27 10:31:26
huanyuezhi: 金币+10, 明白了！感谢大大耐心解答！ 2019-03-28 08:06:12
个人的理解是：分子动力学是基于一个构型在时间轴上受力、位移、速度的运算，统计力学是你需要计算一些宏观物理量，比如压力、密度、温度、焓值，自由能等时，从微观的参数向宏观的转化。比如你计算压力，你不应该直接从微观的角度，对一个原子求势能，然后除以原子体积。正确的做法是，求一大堆原子的势能和，然后对一大堆原子的体积求一阶导，得到一帧的压力值，然后重复同样的步骤，对N帧的压力值求平均（一般而言 N>25， 假设你的体系已经平衡），这才是分子动力学模拟中用统计力学求物理值的方法。至于你说的RDF，个人觉得，如果是很多帧的RDF应该是统计力学，如果只是一帧的RDF，应该可以直接说是分子动力学的RDF.

希望以上对你有一些帮助！
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8楼2019-03-27 09:33:51
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Nater1ver

木虫 (正式写手)
★
huanyuezhi(金币+1): 谢谢参与
学而不思则罔，思而不学则殆，百度百科之于学术，既不严谨，也不系统，以百科为纲，不仅得不到任何好处，还有可能被带偏。事实上只要认真学过统计物理，做过MD的人，不可能对这个概念产生模糊，一个是理想的理论模型，一个是基于理论模型的应用，一目了然。如果仅仅做过MD，只是知其然不知其所以然，心里总归没有底，这个数据为什么可以这样得到？反之亦然。所以说不仅要积累理论，更重要的还是要尽早地投入实践，不然无异于盲人摸象，事前一些模糊的概念，只要做一次其实就了然了

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9楼2019-03-27 10:51:34
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peng660

新虫 (小有名气)
★
huanyuezhi(金币+1): 谢谢参与
md跑完的数据需要进行统计分析

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4楼2019-03-27 00:30:16
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youngen2楼
2019-03-26 21:05   回复  
huanyuezhi(金币+1): 谢谢参与
TT CHOW3楼
2019-03-26 21:45   回复  
huanyuezhi(金币+1): 谢谢参与
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xhmaohan5楼
2019-03-27 01:09   回复  
huanyuezhi(金币+1): 谢谢参与
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tzynew6楼
2019-03-27 07:11   回复  
huanyuezhi(金币+1): 谢谢参与
nono20097楼
2019-03-27 07:23   回复  
huanyuezhi(金币+1): 谢谢参与
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Biotage10楼
2019-03-27 14:18   回复  
huanyuezhi(金币+1): 谢谢参与
sz_kebaoyuan11楼
2019-03-27 14:22   回复  
huanyuezhi(金币+1): 谢谢参与
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