30楼: Originally posted by paramecium86 at 2019-04-13 09:48:34
像上次那个文件里那么多松散的分子加上去 几乎很收敛到最优结果的。这个离子液体在反应中起到什么作用？或者说你预设的这个离子液体会对这个反应起到什么效果？是相当于催化剂吗？还是说可以当做一般的溶剂来考虑？ ...

31楼: Originally posted by 15645016370 at 2019-04-12 21:03:41
离子液体充当一种催化剂，如果不考虑离子液体的作用，单纯的放在优化结构里，能收敛吗？而且我这个还是两分子果糖的过渡态。
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32楼: Originally posted by paramecium86 at 2019-04-13 10:06:03
如果确定是催化作用 那最好先预先估计一个可能的催化机理 然后根据这个机理来做反应路径  这样才有目的性。 要不然只是把分子摆在一起 高斯自动去找 几乎是不可能找得到想要的结果。...

3楼: Originally posted by paramecium86 at 2019-03-23 10:03:58
只是DFT计算的话 那就用高斯就可以。

计算反应机理给出反应路径 是一套计算 需要不少计算方面的知识。

算反应路径基本的思路是对反应路径上的反应物， 各个intermediate和各个TS，和 产物 进行结构优化和振动 ...

34楼: Originally posted by 15645016370 at 2019-04-15 04:38:36
您好我想请问一下，优化一个结构，可以同时存在两个过渡态吗？像我这个是两分子果糖的？
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35楼: Originally posted by paramecium86 at 2019-04-15 20:38:23
不会“同时”存在两个过渡态。过渡态是势能曲线上的顶点。 反应路径上势能曲线的横坐标是分子结构 也就是同一个结构在一条势能曲线上只会有只会有一种过渡态。两个过渡态要么是结构不一样，也就是这是分步反应 两种 ...

36楼: Originally posted by 15645016370 at 2019-04-15 11:13:44
所以说，虽然我这个是具有同时催化两个果糖进行脱水反应的催化剂。但是，我还只能对一分子果糖进行过渡态优化，另一个就不管他，放在那呗？
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37楼: Originally posted by paramecium86 at 2019-04-16 03:05:09
从描述来看  如果那俩果糖分子是没有相互作用的  就不需要同时考虑。而且我对这个反应还是不知道预想中的反应机理是什么。这个同时脱水比较有意思  这个是实验测出来的么？有没有可能是先脱掉一个果糖上的水 然后再 ...

38楼: Originally posted by 15645016370 at 2019-04-15 17:21:22
1.您看下图是我推测的反应机理，
2.为啥非得是两分子的果糖，因为我这个是双阳的离子液体，比一般的单阳离子液体效率更高。
3.如果是这种情况，能同时优化果糖的过渡态吗？虚频会是两个？

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