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【调剂】北京石油化工学院2024年16个专业接受调剂
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rocisky7

金虫 (正式写手)

[求助] materials studio怎么导出各原子坐标信息?已有2人参与

我想知道结构中所有原子的坐标,方便后续处理,请问该怎么导出,导出什么格式的才可以用?

materials studio怎么导出各原子坐标信息?
坐标.PNG
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jiaozihao

新虫 (小有名气)

引用回帖:
9楼: Originally posted by rocisky7 at 2019-03-11 12:42:09
多谢,不过我用记事本和写字板打开,显示都很乱,是要用SQLServer打开吗?您说的perl脚本的方法,不知是在哪里写呢...

在记事本里里写也可以其实,我用的是notepad++。可以去网上搜索一下计算坐标的perl脚本,参考那种格式写一下,到时候直接导入MS中运行就行

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10楼2019-03-11 14:16:36
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普通回帖

jiaozihao

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
可以导出.car类型的文件方便做lammps处理

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» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2019-03-10 19:50:13
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rocisky7

金虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by jiaozihao at 2019-03-10 19:50:13
可以导出.car类型的文件方便做lammps处理

谢谢您的回答,不过我想直接根据原子坐标信息来计算键长键角的平均值等信息,不做进一步仿真了,您看这个该怎么办
3楼2019-03-10 21:15:35
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strong_fruit

铜虫 (正式写手)

导出cif格式,用写字板打开就可以

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2019-03-11 09:28:29
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rocisky7

金虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by strong_fruit at 2019-03-11 09:28:29
导出cif格式,用写字板打开就可以

谢谢您,不过cif只能导出晶体格式的,我这个是非晶态的,导不出cif哎
5楼2019-03-11 10:36:53
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微笑述说忧伤

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

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感谢参与,应助指数 +1
rocisky7: 金币+50, ★★★很有帮助 2019-03-11 12:37:55
mudules-CASTEP——calculation——files——save files,然后在MS的保存路径里有个documents文件夹,里面有个后缀为  .cell 的文件(为掩藏文件,如果没设置显示掩藏,开下掩藏),你可以试试,看看能不能得到你想要的。
6楼2019-03-11 11:14:35
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jiaozihao

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

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rocisky7: 金币+50, ★★★很有帮助 2019-03-11 12:42:22
引用回帖:
3楼: Originally posted by rocisky7 at 2019-03-10 21:15:35
谢谢您的回答,不过我想直接根据原子坐标信息来计算键长键角的平均值等信息,不做进一步仿真了,您看这个该怎么办...

只要导出了.car文件,会生成一个.mdf文件,打开就有坐标信息了。其实如果统计键长键角信息的话可以在ms上自己写perl脚本处理,坐标导出来再用matlab啥的感觉太麻烦

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7楼2019-03-11 11:36:21
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rocisky7

金虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 微笑述说忧伤 at 2019-03-11 11:14:35
mudules-CASTEP——calculation——files——save files,然后在MS的保存路径里有个documents文件夹,里面有个后缀为  .cell 的文件(为掩藏文件,如果没设置显示掩藏,开下掩藏),你可以试试,看看能不能得到你想 ...

多谢您,是应该用记事本打开吗,我用记事本打开了,确实有原子坐标,多谢
8楼2019-03-11 12:37:39
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rocisky7

金虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by jiaozihao at 2019-03-11 11:36:21
只要导出了.car文件,会生成一个.mdf文件,打开就有坐标信息了。其实如果统计键长键角信息的话可以在ms上自己写perl脚本处理,坐标导出来再用matlab啥的感觉太麻烦
...

多谢,不过我用记事本和写字板打开,显示都很乱,是要用SQLServer打开吗?您说的perl脚本的方法,不知是在哪里写呢
9楼2019-03-11 12:42:09
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