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R语言RDA分析结果环境因子丢失已有1人参与
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用R语言做RDA分析，分析环境因子与物种的相关性。有27的样本，31个物种，14个环境因子。但是最后输出的环境因子得分表“Biplot scores for constraining variables”只始终只显示13个环境因子是什么情况？！如下图： Biplot scores for constraining variables RDA1 RDA2 RDA3 RDA4 RDA5 RDA6 pH 0.72821 -0.19612 0.1184 0.19122 0.08395 0.10733 OM 0.38554 0.47874 0.1181 -0.02857 0.11498 -0.48776 TN 0.73116 0.33364 0.2177 -0.03100 0.07174 -0.34673 TP -0.04849 -0.41308 -0.1871 -0.15836 -0.08927 0.05022 TK 0.75387 0.45720 0.2316 -0.03594 -0.03442 -0.05298 AP -0.41504 -0.48984 -0.2201 -0.13396 0.02101 0.01788 AK 0.70815 0.27989 0.2048 -0.41873 0.05153 0.02965 ExcMg 0.72558 0.40693 0.4657 -0.10105 -0.05075 -0.11044 ExcCa 0.81450 0.40690 0.3104 0.02167 0.14413 -0.09215 FDA -0.21766 0.10116 -0.1157 0.16324 -0.15685 -0.28438 Urcase -0.28503 -0.31898 0.2723 0.14498 -0.22572 0.18274 Sucrase 0.02602 0.08977 0.3645 -0.23123 0.21854 0.27002 Catalase 0.13714 0.23087 0.1453 -0.09459 0.02836 0.15450 关键是最开始显示分析结果的时候还是14个环境因子，如下图。 Call: rda(formula = spp ~ pH + OM + TC + TN + TP + TK + AP + AK + ExcMg + ExcCa + FDA + Urcase + Sucrase + Catalase, data = fcc) Partitioning of variance: Inertia Proportion Total 0.08118 1.0000 Constrained 0.04649 0.5727 Unconstrained 0.03469 0.4273 就缺一个TC求大神指教！ |
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