【调剂】北京石油化工学院2024年16个专业接受调剂
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我是东成西就

银虫 (正式写手)

[求助] lammps计算热导率自带算例求助已有1人参与

请教各位,如下lammps自带算例中的convert是用于计算转换因子scale的,请问convert和scale是如何确定的?非常感谢各位的帮助!
以下是自带算例的输入脚本:
# Sample LAMMPS input script for thermal conductivity of solid Ar

units       real
variable    T equal 70
variable    V equal vol
variable    dt equal 4.0
variable    p equal 200     # correlation length
variable    s equal 10      # sample interval
variable    d equal $p*$s   # dump interval

# convert from LAMMPS real units to SI

variable    kB equal 1.3806504e-23    # [J/K] Boltzmann
variable    kCal2J equal 4186.0/6.02214e23
variable    A2m equal 1.0e-10
variable    fs2s equal 1.0e-15
variable    convert equal ${kCal2J}*${kCal2J}/${fs2s}/${A2m}

# setup problem

dimension    3
boundary     p p p
lattice      fcc 5.376 orient x 1 0 0 orient y 0 1 0 orient z 0 0 1
region       box block 0 4 0 4 0 4
create_box   1 box
create_atoms 1 box
mass         1 39.948
pair_style   lj/cut 13.0
pair_coeff   * * 0.2381 3.405
timestep     ${dt}
thermo       $d

# equilibration and thermalization

velocity     all create $T 102486 mom yes rot yes dist gaussian
fix          NVT all nvt temp $T $T 10 drag 0.2
run          8000

# thermal conductivity calculation, switch to NVE if desired

#unfix       NVT
#fix         NVE all nve

reset_timestep 0
compute      myKE all ke/atom
compute      myPE all pe/atom
compute      myStress all stress/atom NULL virial
compute      flux all heat/flux myKE myPE myStress
variable     Jx equal c_flux[1]/vol
variable     Jy equal c_flux[2]/vol
variable     Jz equal c_flux[3]/vol
fix          JJ all ave/correlate $s $p $d &
             c_flux[1] c_flux[2] c_flux[3] type auto file J0Jt.dat ave running
variable     scale equal ${convert}/${kB}/$T/$T/$V*$s*${dt}
variable     k11 equal trap(f_JJ[3])*${scale}
variable     k22 equal trap(f_JJ[4])*${scale}
variable     k33 equal trap(f_JJ[5])*${scale}
thermo_style custom step temp v_Jx v_Jy v_Jz v_k11 v_k22 v_k33
run          100000
variable     k equal (v_k11+v_k22+v_k33)/3.0
variable     ndens equal count(all)/vol
print        "average conductivity: $k[W/mK] @ $T K, ${ndens} /A^3"@smutao@oxox6085
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snail594

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
这部分写的都很明白了:
variable    kB equal 1.3806504e-23    # [J/K] Boltzmann
variable    kCal2J equal 4186.0/6.02214e23
variable    A2m equal 1.0e-10
variable    fs2s equal 1.0e-15
variable    convert equal ${kCal2J}*${kCal2J}/${fs2s}/${A2m}
其中的变量kCal2等就是几个能量、长度、时间单位的转换。比如从卡路里到焦耳。从fs到s。
Inlearningwetrust
2楼2019-02-17 12:13:38
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S-Loser

新虫 (正式写手)

楼主你好,你这里说的脚本就是in文件吗

发自小木虫Android客户端
3楼2019-02-22 15:45:30
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