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fengzhigu521至尊木虫 (著名写手)
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[求助]
cp2k算到一半就不动了可能是什么原因？
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1、cp2k编译好之后，尝试算官网上si的算例（附2），算到下述的no outer scf的位置out文件（附1）就不变了，但程序仍然是在运行状态，即使继续让它运行两个多小时仍然没有变化，请问可能是什么原因引起的？ 2、随后手动停止任务，slurm的输出文件显示为附3所示。 附1：out文件相关内容 scf parameters density guess: atomic -------------------------------------------------------- max_scf: 300 max_scf_history: 0 max_diis: 4 -------------------------------------------------------- eps_scf: 1.00e-07 eps_scf_history: 0.00e+00 eps_diis: 1.00e-01 eps_eigval: 1.00e-05 -------------------------------------------------------- level_shift [a.u.]: 0.00 -------------------------------------------------------- mixing method: broyden_mixing charge density mixing in g-space -------------------------------------------------------- no outer scf 附2：inp文件中scf相关内容 &SCF SCF_GUESS ATOMIC EPS_SCF 1.0E-7 MAX_SCF 300 &DIAGONALIZATION ON ALGORITHM STANDARD &END DIAGONALIZATION &MIXING T METHOD BROYDEN_MIXING ALPHA 0.4 NBROYDEN 8 &END MIXING &END SCF &END DFT &FORCES ON &END FORCES &END PRINT &END FORCE_EVAL 附3： yhrun: job step aborted: waiting up to 2 seconds for job step to finish. yhrun: got sigcont slurmd[cn13374]: *** step 1545711.0 cancelled at 2019-01-16t19:01:49 *** slurmd[cn13374]: *** job 1545711 cancelled at 2019-01-16t19:01:49 *** yhrun: forcing job termination forrtl: error (78): process killed (sigterm) image pc routine line source cp2k.psmp 00000000087aa9ae unknown unknown unknown libpthread-2.12.s 000000392220f710 unknown unknown unknown cp2k.psmp 0000000002c92f69 dbcsr_operations_ 264 dbcsr_operations.f cp2k.psmp 00000000088cfeb3 unknown unknown unknown cp2k.psmp 0000000008886988 unknown unknown unknown cp2k.psmp 0000000008868c86 unknown unknown unknown cp2k.psmp 0000000002c930a4 dbcsr_operations_ 263 dbcsr_operations.f cp2k.psmp 000000000099e329 qs_rho_methods_mp 194 qs_rho_methods.f cp2k.psmp 000000000177a28c qs_update_s_mstru 286 qs_update_s_mstruct.f cp2k.psmp 00000000011900d6 qs_energy_init_mp 298 qs_energy_init.f cp2k.psmp 00000000011927d7 qs_energy_init_mp 108 qs_energy_init.f cp2k.psmp 0000000001514bc9 qs_energy_mp_qs_e 77 qs_energy.f cp2k.psmp 000000000185c231 qs_force_mp_qs_fo 212 qs_force.f cp2k.psmp 000000000185a71f qs_force_mp_qs_ca 113 qs_force.f cp2k.psmp 0000000000f9f053 force_env_methods 242 force_env_methods.f cp2k.psmp 0000000000492710 cp2k_runs_mp_run_ 325 cp2k_runs.f cp2k.psmp 0000000000460696 main__ 281 cp2k.f cp2k.psmp 000000000045f31e unknown unknown unknown libc-2.12.so 0000003921a1ed1d __libc_start_main unknown unknown cp2k.psmp 000000000045f229 unknown unknown unknown forrtl: error (78): process killed (sigterm) ... |
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fengzhigu521
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