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wanghai8282

铁虫 (正式写手)

[求助] bowtie2 软件makefile文件编译成适合于windows64位的已有1人参与

求助本版的兄弟姐妹,本人生物信息学小白,想在window7 下使用bowtie2软件。一直没有找到合适的方法安装bowtie2. 苦恼中。
在网上找到一个在windows 64位上编译bowtie2的网页(compile bowtie2 on windows 64 bit.)按照他的做法去做了。但是还是各种错误。哪位大神有合适的方法可以指教?
或者能帮我解析一下这个错误是什么意思,帮我修改到适合win7-64位。


makefile文件一同传上,求带路。bowtie2 软件makefile文件编译成适合于windows64位的
wenti.jpg
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  • 附件 1 : Makefile
  • 2019-01-05 14:36:33, 16.41 K

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badsunday

新虫 (小有名气)


jjdg: 金币+1, 感谢参与 2019-04-19 11:17:05
安装一下python,bowtie下载windows版本。把makefile改成makefile.py就能用了。

发自小木虫Android客户端
2楼2019-01-06 08:15:48
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wanghai8282

铁虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by badsunday at 2019-01-06 08:15:48
安装一下python,bowtie下载windows版本。把makefile改成makefile.py就能用了。

谢谢您的回复。我看官网上bowtie2说是必须安装mingw,在msys环境下才能安装。您说的这个bowtie的windows版本,在哪里可以下载

发自手机版WAP
3楼2019-01-06 13:42:09
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4楼2019-01-06 14:14:54
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badsunday

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
3楼: Originally posted by wanghai8282 at 2019-01-06 13:42:09
谢谢您的回复。我看官网上bowtie2说是必须安装mingw,在msys环境下才能安装。您说的这个bowtie的windows版本,在哪里可以下载
...

我搞错了,bowtie1有,bowtie2没有。

发自小木虫Android客户端
5楼2019-01-06 23:27:41
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东大小生

木虫 (正式写手)


jjdg: 金币+1, 感谢参与 2019-04-19 11:17:19
虽然不是相关专业,但从报错来看,windows并没有which命令,所以就没办法通过which查找到gcc路径,可以考虑改成where。(后面的cat命令也是linux下的)
:)
6楼2019-04-17 18:19:49
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cyfjkf

铁杆木虫 (正式写手)

7楼2019-05-02 09:23:16
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