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LBXMC

铁虫 (初入文坛)

[求助] BLASTX比对后，如何找转录组库得到的序列的保守区域，求教！！！先谢过！

您好，求教！！！不胜感激！！！
       我的情况如下，在确定要做基因X之后，在我的转录组库里找到已经注释到某其他关系较近物种的核酸片段，把它放到NCBIx比对，和一个已发表的不同物种的同原蛋白有较高的相似度，达90%左右，我觉得应该可能是了，请问我该怎么找到比对上的相对应的保守序列，来进一步设计引物做RACE呢。另外，我有找过这段序列的ORF区，非常短，再放到库里比发现没有和之前的那个蛋白比到一起，我该怎么办呢？
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Nothing is impossible!
1楼2018-12-22 00:22:53
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5斤亲戚

新虫 (初入文坛)
QQ965092653，我最近也在做这个，可以一起交流一下

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2楼2019-03-15 16:48:39
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小木頭

新虫 (小有名气)
我找的基因相似度达不到那么高 但是相似物种里面预测到这个基因 那能不能确定是不是我想要的这个基因？

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3楼2019-05-31 17:04:37
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