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LBXMC

铁虫 (初入文坛)

[求助] BLASTX比对后,如何找转录组库得到的序列的保守区域,求教!!!先谢过!

您好,求教!!!不胜感激!!!
       我的情况如下,在确定要做基因X之后,在我的转录组库里找到已经注释到某其他关系较近物种的核酸片段,把它放到NCBIx比对,和一个已发表的不同物种的同原蛋白有较高的相似度,达90%左右,我觉得应该可能是了,请问我该怎么找到比对上的相对应的保守序列,来进一步设计引物做RACE呢。另外,我有找过这段序列的ORF区,非常短,再放到库里比发现没有和之前的那个蛋白比到一起,我该怎么办呢?
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Nothing is impossible!
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5斤亲戚

新虫 (初入文坛)

QQ965092653,我最近也在做这个,可以一起交流一下

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2楼2019-03-15 16:48:39
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小木頭

新虫 (小有名气)

我找的基因相似度达不到那么高 但是相似物种里面预测到这个基因 那能不能确定是不是我想要的这个基因?

发自小木虫IOS客户端
3楼2019-05-31 17:04:37
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