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百奥赛图

新虫 (小有名气)

[交流] 【干货】常见实验大/小鼠命名原则已有1人参与

姓名是个体的代名词,我们一般通过名字去识别记录一个人或某个个体。很久很久以前,“姓名”一词就已被使用 。在《孙子·用间》中的“必先知其守将、左右、谒者、门者、舍人之姓名,今吾间必索知之”便已提及姓名一词。

    而我们的鼠鼠们也不是“无名氏”哦!早在鼠鼠出生之前,就已经为它们起好名字了呢!当然,鼠鼠们的重名率非常高,但这并不是因为我们懒,而是因为它们长得太像了!!!

    Jackson作为小鼠模型的金标准,他们所采用的鼠命名原则被业界广泛认可。为了让大家更加清楚了解鼠鼠们是如何“贴标签”的,下面我们就来介绍一下Jackson的命名方法。

Jackson实验室小鼠命名--金标准



【干货】常见实验大/小鼠命名原则



    相信通过以上的介绍,大家一定对小鼠命名有所了解了。

    而百奥赛图作为一所基因生物技术公司,依托于CRISPR技术构建小鼠模型,是很多科研院所和公司的合作单位。而Jackson实验室小鼠命名方式对于CRISPR编辑技术显得有些冗杂,不够清晰明了。

    为让客户能够快速选取合适的模式小鼠,百奥赛图结合小鼠命名准则以及公司产品鼠的情况,编辑了一套公司特有的命名模式,下面就来为大家介绍一下:

一、命名原则



● 正规命名:以国际通用, Jackson实验室命名标准为参考,要求基因名称书写准确,标准,规范。

● 常规命名:以使用方便,表达精炼美观为主,要求符合大多数人使用习惯。

● 包含信息:动物名称,基因名称,基因组的编辑,实验室(公司)简称等等。

二、命名构成



1、(以B-hPD-1 mice为例)-正规命名
【干货】常见实验大/小鼠命名原则-1
● 小鼠背景
● 基因名缩写(必须是NCBI基因正式名)
● 打靶策略记录(targeted mutation 1/2/3…)
● 打靶策略标注(人源化用h+人基因名称书写)
● 公司缩写(实验室缩写)

● !!!一定要记录实验室或是公司简称,因为鼠鼠们自身基因以及表型会受环境影响。

2、(以B-hPD-1 mice为例)-常规命名
B-hPD-1 mice
● 公司缩写(必修标注)
● 人源化标记(非人源化可忽略)
● 基因缩写
● 物种类别

表. 其它打靶策略命名


【干货】常见实验大/小鼠命名原则-2



3、(以B-hPD-1 mice为例)-其它原则
● 若基因除NCBI上的正式名外还有常用名,可在基因正规名后用括号标注:如PD-L1基因的正式名为CD274,常用名为PD-L1,则该基因人源化小鼠的常规命名全称为:B-hCD274(PD-L1) mice,也可成为B-hPD-L1 mice。

● 鼠基因写法与人的不同:人的基因用全部大写字母表示,而鼠的基因则是首字母大写,其余小写,如PD-1则为人的基因,Pd1则表示鼠的基因。

大家了解了么?若有疑问,欢迎大家随时致电咨询。也希望大家能够找到自己心仪的小鼠!

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【干货】常见实验大/小鼠命名原则-3

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