| 查看: 577 | 回复: 5 | |||
[交流]
【分享】第九届中国分子诊断技术大会亮点报告
|
|||
|
2018年11月9日，由中国工程院医药卫生学部、清华大学、生物芯片北京国家工程研究中心主办，中国工程院整合医学研究院、中国医药生物技术协会生物芯片分会、中山大学肿瘤防治中心、广东省抗癌协会承办的“2018医学前沿论坛暨第九届中国分子诊断技术大会”在广州隆重召开。 会议邀请了来自中国科学院、中国工程院的近十名院士，国内外生物医学界专家代表，行业精英，企业代表以及媒体朋友等1000余人参会。中国工程院三局王元晶副局长、广东省科技厅龚国平副厅长、中山大学校长罗俊院士、中山大学肿瘤防治中心徐瑞华院长、中山大学肿瘤防治中心武少新书记、中国科学院和中国工程院的樊代明院士、王辰院士、程京院士、夏咸柱院士、周宏灏院士、徐建国院士、金力院士、卞修武院士以及国医大师王琦教授莅临会议现场，此外还有近20位来自国内外的顶级学者和专家应邀参会并作精彩的大会报告。 中国疾病预防控制中心传染病预防控制国家重点实验室主任徐建国院士分享了题为《细菌宏分类组学metataxonomics》的精彩报告。随着测序技术的进步，观察细菌方法由染色涂片，转变为对细菌16S rRNA的测定，16S rRNA序列分析是细菌鉴定和多样性分析中应用最广泛的技术。徐建国院士通过使用PacBio序列分析平台，获得了几乎全长的16S rRNA基因序列，并使依赖16S rRNA序列分析的细菌学分类达到种的水平。并以青藏高原秃鹫、高原旱獭、藏羚羊等为研究对象，发现了大量未知的病原菌，命名了十余种新的病原微生物，对于我国重大传染病疫情或事件的防控具有重要的意义。 2017年《宏分类组学分析青藏高原秃鹫肠道菌群及放线菌新种的发现》16S rRNA中应用Pacbio测序平台研究步骤： （１）菌群总１６ＳｒＲＮＡ基因扩增：９只秃鹫粪便样本中各自细菌总１６ＳｒＲＮＡ基因分别利用带有不同ｂａｒｃｏｄｅ序列的引物８Ｆ，１４９２Ｒ进行大体系扩增；ＰＣＲ扩增参数：预变性９４°Ｃ，５ｍｉｎ；２５个循环：变性９４°Ｃ３０ｓ，退火５２°Ｃ３０ｓ，延伸720℃ｌｍｉｎ３０ｓ；终延伸７２°Ｃ７ｍｉｎ；扩增产物利用ＤＮＡ片段纯化试剂盒纯化。 （２）三代测序：构建文库后采用ＰａｃＢｉｏＲＳＩＩ平台，使用Ｐ６－Ｃ４试剂，测序在天津生物芯片技术有限责任公司完成。�? （３）三代数据处理：下机后原始ＣＣＳ（ｃｉｒｃｕｌａｒｃｏｎｓｅｎｓｕｓｓｅｑｕｅｎｃｅ）数据利用ＰａｃＢｉｏ官方网站提供的ＳＭＲＴＡｎａｌｙｓｉｓ（ｖｅｒｓｉｏｎ２．３．０）（ｗｗｗ．ｐａｃｂ．ｃｏｍ／ｄｅｖｎｅｔ／）按照ｂａｒｃｏｄｅ序列拆分为不同样本，拆分时ｂａｒｃｏｄｅ参数选择最小值２２运行（即允许错误率０．０５％）。原始序列的截取和初步过滤：去除包含Ｎ碱基的序列；因序列中包含正向、反向序列，所以调整序列方向一致；保留含有上下游引物的序列，然后去除引物和接头序列，去除序＜１，２００ｂｐ或者＞１６００ｂｐ序列；为了进一步避免引物或者接头序列的影响，截取比对后序列的第１０ｂｐ—１４９０ｂｐ的序歹！］；得到的序列利用Ｑｉｉｍｅ软件（Ｑｉｉｍｅ－１．８．０－ｒｅｌｅａｓｅ）进行进一步序列质控，去掉序列的质量值低于某一阈值的序列，参数为默认值；利用ＵＣＨＩＭＥ，ＲＤＰＣｌａｓｓｉｆｉｅｒ去除嵌合体序列；最后为了保证１６ＳｒＲＮＡ序列长度，过滤掉序列＜１，３００ｂｐ的序列；稀疏曲线通过ＰＡＳＴ（ｖｅｒｓｉｏｎ１．８２ｂ）分析，Ｇｏｏｄ’ｓｃｏｖｅｒａｇｅ分析。�? |
回复此楼» 猜你喜欢
研二光催化6月底四篇二区什么水平
已经有15人回复
-
没学上
已经有10人回复
-
真的好想读博！
已经有19人回复
-
如何分离原料与产品
已经有12人回复
-
基金开始函评了吗？
已经有15人回复
-
环肽的合成
已经有5人回复
-
学硕专硕
已经有5人回复
-
0854－0855调剂
已经有12人回复
-
with editor 两个月了，什么原因？
已经有15人回复
-
博士白读了
已经有48人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
诚征女友结婚，愿得一人心，白首不相离
+1/953
-
征稿ing,征集编委和审稿人
+1/212
-
海南大学物理与光电工程学院诚聘海内外优秀人才——海聚英才，共创未来
+1/174
-
2020年帖子“我强吻未遂头铁的IT男生好朋友”之2024年后续
+1/93
-
各位虫友，你们工作里遇到过因为学校不行而被优化的吗？
+1/81
-
先进复合材料力学与智能制造团队招聘：研究助理教授、博士后、科研助理等（长期有效）
+1/75
-
北京-89175-事业单位-诚征女友
+1/67
-
成都山地所考博
+1/29
-
无法求助文献
+1/9
-
你的工具箱是不是少个Abaqus？
+1/8
-
合肥 OLED材料合成
+1/8
-
国家杰青、长江学者张卫东教授课题组招收科研助理
+1/7
-
北京航空航天大学招聘科研助理、联培、客座生
+1/3
-
深圳大学跟哈工大联合博士
+1/3
-
中科院博士后、研究助理招聘公告；分子诊断公司研发人员招聘公告
+1/2
-
南京大学高亚飞课题组招聘金属有机化学研究助理（可转组内博士）
+1/2
-
祈福青基中！中！中！中！
+1/2
-
基因敲除
+1/1
-
催化剂压片成型
+1/1
-
南方科技大学陈柔羲教授招聘科研助理
+1/1
+1/953
简单回复
youngen2楼
2018-11-16 16:07
回复
生物小虫007(金币+1): 谢谢参与
nono20093楼
2018-11-16 16:48
回复
生物小虫007(金币+1): 谢谢参与
`
晨曦CXL4楼
2018-11-16 17:06
回复
生物小虫007(金币+1): 谢谢参与
。 发自小木虫Android客户端
2018-11-16 18:41
回复
yanbodr6楼
2018-11-17 21:43
回复
生物小虫007(金币+1): 谢谢参与
。 发自小木虫Android客户端
