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【调剂】北京石油化工学院2024年16个专业接受调剂
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mercypang

金虫 (小有名气)

[求助] 请问基因测序中的RPKM值可以比较不同基因间的丰度吗?已有1人参与

请问基因测序中的RPKM值可以比较不同基因间的丰度吗?
比如,同一个试验中测了11中组织中的某些基因,可以用RPKM比较基因A在不同组织中的含量的多少及基因A与其他基因在同一个组织中的多少吗?
谢谢
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drwhoknowss

荣誉版主 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+3, 鼓励回帖交流 2018-10-15 07:50:16
1. 基因A在不同组织中的含量的多少. 这个没问题,基本是RNA-seq之类试验的标准答案。
2. 基因A与其他基因在同一个组织中的多少。这个智者见智,仁者见仁。每个基因功能不同,调控不同,需要的量不同,风牛马不相及。我的看法是比较起来没有意义。英文的表达是:You can't compare apple to orange.
Progress in science depends on new techniques, new discoveries and new ideas, probably in that order. -- Nobel laureate Sydney Brenner
2楼2018-10-15 03:34:08
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