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Crystalspeng

新虫 (正式写手)

[求助] 这个审稿意见怎么解决?谢谢各位

请问这个审稿人的意见该怎么解决?如下:
It seems to me that theoretical modeling does not provide any valuable information. PES SCAN procedure was used to plot changes of potential energy relative to changes in molecular structure. This is not rigorous method which can be used for careful exploration of PES profile. Accurate modeling of PES requires calculation of Minimum Energy Paths involving localization of TS structures and following IRC calculations for processes with well-defined saddle points. Alternatively, DOWNHILL calculations need to be used for reactions without well-defined transition states.
有如下问题,请帮忙回答下吧,谢谢!
1)柔性扫描给出的势能面不是最小能量路径吗?
2)意见提到的准确的模拟PES,是指把过渡态找出来,然后做个IRC吗?
3)怎样像审稿人说的在不好确定过渡态时,根据反应物进行DOWNHILL计算?
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匿名

本帖仅楼主可见
2楼2018-08-05 08:09:18
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virtualzx

木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★
Crystalspeng(小红豆代发): 金币+5, 感谢交流 2019-02-15 11:41:06
3楼2018-08-05 08:29:13
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星风作浪

禁虫 (著名写手)

本帖内容被屏蔽

4楼2018-08-05 12:12:25
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Crystalspeng

新虫 (正式写手)

谢谢大家,2)和3)问题希望有人帮忙指点下,谢谢!
5楼2018-08-05 18:24:12
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Crystalspeng

新虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★
小红豆: 金币+5, 感谢交流 2019-02-15 11:40:47
引用回帖:
2楼: Originally posted by cheche2017 at 2018-08-05 08:09:18
你的计算没有任何的价值,审稿人说的,估计这人搞理论很厉害,好好整理下思路,说明计算的价值

一般文献上,判断反应通道也都是柔性扫描的方法的
6楼2018-08-05 18:37:22
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Crystalspeng

新虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by virtualzx at 2018-08-05 08:29:13
1)不是

谢谢答复
7楼2018-08-05 18:37:43
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virtualzx

木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
Crystalspeng(小红豆代发): 金币+15, 感谢交流 2019-02-15 11:40:31
引用回帖:
5楼: Originally posted by Crystalspeng at 2018-08-05 18:24:12
谢谢大家,2)和3)问题希望有人帮忙指点下,谢谢!

2)如果有势垒,用NEB一类方法优化过渡态。如果没有办法用,可以先做TS优化,优化结束后用IRC确定这个过渡态是不是连接反应物和产物。3)如果没有势垒,那你至少要找一条能量单调递减的反应路径

柔性扫描只能提供一个反应路径和势垒的定性猜测,很多情况下定性都不正确,一般是做实验的人做计算装门面才用的。如果只是实验的辅助没关系,你如果定位是计算工作那是上不了台面的

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» 本帖已获得的红花(最新10朵)

8楼2018-08-06 13:26:10
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Crystalspeng

新虫 (正式写手)

非常感谢您的回复。我的目的是想通过柔性扫描来判断哪个通道能发生反应,以及哪个通道的反应势垒最低,找到后再用寻找过渡态及irc方法确认。在不知道是否能发生反应和发生什么反应之前,除了用柔性扫描还可以用什么方法。审稿人的意思是要用DOWNHILL方法吗?

发自小木虫Android客户端
9楼2018-08-06 20:16:42
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Crystalspeng

新虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
8楼: Originally posted by virtualzx at 2018-08-06 13:26:10
2)如果有势垒,用NEB一类方法优化过渡态。如果没有办法用,可以先做TS优化,优化结束后用IRC确定这个过渡态是不是连接反应物和产物。3)如果没有势垒,那你至少要找一条能量单调递减的反应路径
柔性扫描只能提供一 ...

谢谢您解答,如有时间,请帮忙再解答下后面的疑问,谢谢啦

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10楼2018-08-06 20:20:52
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