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zhjh888888

银虫 (小有名气)

[求助] 任务无法提交到计算节点，请帮忙处理！

系统信息如下：

操作系统：Rocks 6.1.1 (Sand Boa) linux
ssh 可以登录到计算节点，但是qsub提交到计算节点后，任务不运行。提交到管理节点运行
cluster为管理节点，compute-0-0 和compute-0-1为计算节点。
提交任务脚本:
#!/bin/bash
#
#$ -cwd
#$ -j y
#$ -S /bin/bash
#$ -q all.q@compute-0-1.local
#$ -pe  mpich 8

.............................................
............................................

执行 qhost和qstat -f后的情况如下，可看出计算节点不正常，请为如何解决？谢谢！

[root@cluster ~]# qhost
HOSTNAME                ARCH         NCPU  LOAD  MEMTOT  MEMUSE  SWAPTO  SWAPUS
-------------------------------------------------------------------------------
global                  -               -     -       -       -       -       -
cluster                 linux-x64      40  0.00   94.6G 1003.8M 1024.0M     0.0
compute-0-0             linux-x64      48     -   94.5G       - 1000.0M       -
compute-0-1             linux-x64      48     -   94.5G       - 1000.0M       -

[root@cluster ~]# qstat -f
queuename                      qtype resv/used/tot. load_avg arch          states
---------------------------------------------------------------------------------
[email]all.q@cluster.loca[/email]l            BIP   0/0/40         0.00     linux-x64     
---------------------------------------------------------------------------------
all.q@compute-0-0.local        BIP   0/0/48         -NA-     linux-x64     au
---------------------------------------------------------------------------------
all.q@compute-0-1.local        BIP   0/0/48         -NA-     linux-x64     au
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路在脚下！
1楼2018-06-22 11:03:22
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王亚134

新虫 (初入文坛)
本帖内容被屏蔽
2楼2018-06-22 23:10:18
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zhjh888888

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 王亚134 at 2018-06-22 23:10:18
有兴趣用超算资源计算任务吗 企鹅号523297612

暂时还没有考虑这块，谢谢您！
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路在脚下！
3楼2018-06-23 10:09:38
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xiangpan2015

金虫 (正式写手)
楼主你好，请问你有rocks6.1.1版本所有的ISO吗？官网的链接已经失效了，最新的7.0版本又一直装不上。
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4楼2018-06-25 11:03:57
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xiangpan2015

金虫 (正式写手)
另外，rocks是一个高度集成的系统，计算节点应该没有完整的安装所有组件，所以最好通过主节点给计算节点分配任务
赞一下(1人) 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

zhjh888888
5楼2018-06-25 11:12:01
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zhjh888888

银虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by xiangpan2015 at 2018-06-25 11:03:57
楼主你好，请问你有rocks6.1.1版本所有的ISO吗？官网的链接已经失效了，最新的7.0版本又一直装不上。

我是网络安装的，没有ISO文件，不好意思啊！
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路在脚下！
6楼2018-06-25 21:15:04
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zhjh888888

银虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by xiangpan2015 at 2018-06-25 11:12:01
另外，rocks是一个高度集成的系统，计算节点应该没有完整的安装所有组件，所以最好通过主节点给计算节点分配任务

嗯，谢谢您的回复！
这两天通过参考前辈们的经验[1-3]及自己的摸索，已经基本安装好了SGE（暂时装了一个管理节点cluster和一个计算节点compute-0-1）。qhost和qstat -f执行后均已正常显示（参考附录），提交到两个节点的任务也都能running，但是还有一个问题，就是提交到节点compute-0-1的能变成“r”状态，但还不能执行脚本内容。如您或哪位老师知道原因，请不吝指教，非常感谢！

附录：[root@compute-0-1 ~]# qhost
HOSTNAME                ARCH         NCPU  LOAD  MEMTOT  MEMUSE  SWAPTO  SWAPUS
-------------------------------------------------------------------------------
global                  -               -     -       -       -       -       -
cluster                 linux-x64      40  8.01   94.6G   10.7G 1024.0M     0.0
compute-0-1             linux-x64      48  0.09   94.5G  999.8M 1000.0M     0.0
[root@compute-0-1 ~]# qstat -f
queuename                      qtype resv/used/tot. load_avg arch          states
---------------------------------------------------------------------------------
all.q@cluster.local            BIP   0/8/40         8.01     linux-x64     
---------------------------------------------------------------------------------
all.q@compute-0-1.local        BIP   0/0/48         0.09     linux-x64  

参考文献
[1]https://blog.csdn.net/leijunan/article/details/39608849
[2]崔再续，SGE 安装及使用文档（2011-8-21）
[3]http://blog.chinaunix.net/uid-24404943-id-3480812.html
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路在脚下！
7楼2018-06-25 21:29:57
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