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wangxueru

新虫 (小有名气)

[求助] Xcalibur看液质图谱时,Ranges这个界面怎么操作可以看母离子和子离子的对应关系呢?已有1人参与

如下图,在Xcalibur软件下,打开液质文件后,在色谱图中,点击右键进入Ranges

1. Scan Filter里面,有很多类似“ITMS + c ESI sid=35.00  d Full ms2 518.32@cid35.00 [130.00-530.00]” 的选项,请问这是什么意思呢?

2. Plot type里面,有TIC、Mass Range、Base Peak、Neutral Fragment四个选项,除了TIC以外,选另外三个时,下一行Ranges就也可以填写了,分别应该填什么呢?

3. 如何调出母离子和子离子的色谱图和质谱图呢?

万分感谢!!!

Xcalibur看液质图谱时,Ranges这个界面怎么操作可以看母离子和子离子的对应关系呢?
屏幕快照 2018-05-31 上午10.12.30.png
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紫筱枫影

木虫 (正式写手)

引用回帖:
9楼: Originally posted by wangxueru at 2018-06-06 09:24:46
嗯嗯,多谢您!明白啦!

如果一级的正离子模式下找不到m/z=+母离子,就说明有可能以多电荷离子存在吗?

什么情况下会产生多电荷离子呢?比如什么类型的化合物或者什么类型的质量分析器?...

自己按公式算一下就知道有没有多电荷的存在了。有些质谱可以直接看到电荷数。

带不带多电荷跟结构有关,比如存在聚集体的情况。现在质谱基本都是ESI源,就会出现多电荷,跟分析器没关系。

比如M=500,带一个电是501,带两个电是251,带三个电是167.7
10楼2018-06-06 11:31:28
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Fu_shulin

木虫 (正式写手)

问题1 518.32在cid35条件下打二级,采集130-530的谱图,用esi采的棒状图。2-TIC总离子流图,mass Range 就是你想看哪个离子就输入哪个离子

发自小木虫Android客户端
2楼2018-05-31 11:26:37
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紫筱枫影

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
对啊,你看到的每个filter就是母离子、子离子的对应关系,没错。
选择这几个plot不用填ranges,
ranges填上你想提取的某个离子的离子流,就相当于EIC图
3楼2018-05-31 15:51:27
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紫筱枫影

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
wangxueru: 金币+30, ★★★★★最佳答案 2018-06-06 09:22:15
引用回帖:
7楼: Originally posted by wangxueru at 2018-06-01 20:53:16
非常感谢,大部分都明白啦!还有2个疑问,再麻烦您给解答一下:

1. 一个化合物的母离子和子离子的保留时间不应该是相同才可以用的吗?因为某个m/z值的母/子离子可能在谱图中不同保留时间出现好几次,但只有保留 ...

你看,假如有异构体,碳架异构或者官能团异构,虽然母离子m/z相同,但是二级质谱肯定不同,保留时间也不同。
所以想看母-子离子对的话,肯定是某个保留时间的一级、二级质谱图。不同时间也许不是同一种物质

多电荷m/z=[M+nH]n+ 这样写
8楼2018-06-04 11:47:12
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wangxueru

新虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 紫筱枫影 at 2018-06-04 11:47:12
你看,假如有异构体,碳架异构或者官能团异构,虽然母离子m/z相同,但是二级质谱肯定不同,保留时间也不同。
所以想看母-子离子对的话,肯定是某个保留时间的一级、二级质谱图。不同时间也许不是同一种物质

多 ...

嗯嗯,多谢您!明白啦!

如果一级的正离子模式下找不到m/z=[M+H/Na/K]+母离子,就说明有可能以多电荷离子存在吗?

什么情况下会产生多电荷离子呢?比如什么类型的化合物或者什么类型的质量分析器?
9楼2018-06-06 09:24:46
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紫筱枫影

木虫 (正式写手)

引用回帖:
11楼: Originally posted by wangxueru at 2018-06-08 10:18:27
非常感谢您!

请问您使用xcalibur软件能否查看到多电荷离子呢?

找到的教程上没有相关内容,多谢您了!...

右键-显示选项-标签-带电charge选项给勾上
12楼2018-06-08 15:08:56
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普通回帖

wangxueru

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by Fu_shulin at 2018-05-31 11:26:37
问题1 518.32在cid35条件下打二级,采集130-530的谱图,用esi采的棒状图。2-TIC总离子流图,mass Range 就是你想看哪个离子就输入哪个离子

多谢您!还有几个引申问题想再请教您一下~

1. 如果我在Scan FIlter中选中问题1的这一行,会显示518.32的二级子离子对吗?

2. 我调了几个母离子的子离子,发现有些TIC显示信号只有E2, 这样的子离子是不是响应太弱了可能是噪音呢?子离子信号要强于E几才能用呢?

3. 在子离子的TIC图里,双击查看它的质谱图,发现有比母离子m/z还大的质谱碎片,这些碎片是哪里来的呢?这个图还有分析的意义吗?
4楼2018-05-31 23:07:01
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wangxueru

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 紫筱枫影 at 2018-05-31 15:51:27
对啊,你看到的每个filter就是母离子、子离子的对应关系,没错。
选择这几个plot不用填ranges,
ranges填上你想提取的某个离子的离子流,就相当于EIC图

多谢您!

那么在正离子模式下,Ranges里面应该输入的是目标化合物+H/Na/K的精确分子量;在负离子模式下,Ranges里面应该输入的是目标化合物-H的精确分子量对吗?

每一个目标化合物都是这样来试的吗?ppm值在哪里查看呢?

如果相应保留时间下也有子离子,就可以继续解析了是吗?
5楼2018-05-31 23:10:57
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紫筱枫影

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by wangxueru at 2018-05-31 23:10:57
多谢您!

那么在正离子模式下,Ranges里面应该输入的是目标化合物+H/Na/K的精确分子量;在负离子模式下,Ranges里面应该输入的是目标化合物-H的精确分子量对吗?

每一个目标化合物都是这样来试的吗?ppm值在 ...

1,对,输入想要的m/z
2.每个想要的目标都提取一下。ppm在解谱软件里自动计算,自己算的话就是拿测得值减去理论值,再除以理论值。
3.子离子和母离子是对应关系,和保留时间没有联系。

上面你问的
1.你选的这个质谱图就是518.32的二级质谱图
2.直接看二级信号就行了,不用看响应强度,二级本来就很弱。
3.母离子带多个电荷,子离子的m/z比母离子大。
6楼2018-06-01 15:27:22
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wangxueru

新虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 紫筱枫影 at 2018-06-01 15:27:22
1,对,输入想要的m/z
2.每个想要的目标都提取一下。ppm在解谱软件里自动计算,自己算的话就是拿测得值减去理论值,再除以理论值。
3.子离子和母离子是对应关系,和保留时间没有联系。

上面你问的
1.你选的这 ...

非常感谢,大部分都明白啦!还有2个疑问,再麻烦您给解答一下:

1. 一个化合物的母离子和子离子的保留时间不应该是相同才可以用的吗?因为某个m/z值的母/子离子可能在谱图中不同保留时间出现好几次,但只有保留时间相同的母离子和子离子才是一对?

2. 母离子是多电荷的话,平时写的[M+H]+, 加号(上标)不是表示只带一个电荷的意思吗?那怎么能确定母离子是带几个电荷呢?不然没法推测化合物的分子量呀~
7楼2018-06-01 20:53:16
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