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【调剂】北京石油化工学院2024年16个专业接受调剂
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lyyo

新虫 (初入文坛)


[交流] Autodock vina

我将pdb数据库下载的蛋白配体复合物用autodocktools分离之后用vina重对接,然后自己用chembiodraw画出同一个配体用chem3D优化之后与该蛋白质对接,结果配体两次结合模式相反,怎么回事

Autodock vina
两次对接结果比较.png
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muzi0104

木虫 (知名作家)



lyyo(金币+1): 谢谢参与
ZZZZZZ
7楼2018-05-24 10:48:18
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小米嘉

木虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
再试试,毕竟是随机的。

发自小木虫Android客户端
10楼2018-05-24 16:04:27
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我要去抓妖怪

新虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
1楼: Originally posted by lyyo at 2018-05-24 10:10:43
我将pdb数据库下载的蛋白配体复合物用autodocktools分离之后用vina重对接,然后自己用chembiodraw画出同一个配体用chem3D优化之后与该蛋白质对接,结果配体两次结合模式相反,怎么回事

两次对接结果比较.png...

您是怎样用autodock将配体跟受体分离的呀

发自小木虫IOS客户端
11楼2018-05-25 12:21:42
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侯木虫

新虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
大神,有没有chem3D的安装包分享下?

发自小木虫Android客户端
12楼2018-07-09 23:18:58
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hmjxgxv282楼
2018-05-24 10:33   回复  
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wvsvp7833楼
2018-05-24 10:40   回复  
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mrxkq2314楼
2018-05-24 10:43   回复  
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wtbccq5055楼
2018-05-24 10:43   回复  
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dbptt5446楼
2018-05-24 10:46   回复  
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udcyryh248楼
2018-05-24 10:49   回复  
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2018-05-24 10:49   回复  
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