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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Siesta&Smeagol&Atk » siesta计算提示forrtl: severe (174): SIGSEGV, segmentation fault occurred
【调剂】北京石油化工学院2024年16个专业接受调剂
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ty7922

新虫 (小有名气)

[交流] siesta计算提示forrtl: severe (174): SIGSEGV, segmentation fault occurred已有2人参与

求助！！
现在在做本科毕设，在超算用siesta计算，计算到光学性质时候停下来了

Optical: Performing optical calculation:

Optical: Polarization type       = unpolarized
Optical: Minimum of energy range =   0.0000 Ry
Optical: Maximum of energy range =  10.0000 Ry
Optical: Gaussian broadening     =   0.0000 Ry
Optical: Scissor operator        =   0.0000 Ry
Optical: Number of bands         =      240
Optical: Number of electrons     =      160
Optical: BZ mesh dimensions      =    5   5   5

Optical: Vectors defining the plane that contains the Efield:
Optical:      1.00000     0.00000     0.00000
Optical:      0.00000     1.00000     0.00000

下面是报错：
forrtl: severe (174): SIGSEGV, segmentation fault occurred
Image              PC                Routine            Line        Source            
siesta             0000000000687BB2  Unknown               Unknown  Unknown
siesta             000000000066B54F  Unknown               Unknown  Unknown
siesta             0000000000B6DDBD  Unknown               Unknown  Unknown
siesta             000000000042C7FC  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          00000039C9A1ECDD  Unknown               Unknown  Unknown
siesta             000000000042C729  Unknown               Unknown  Unknown
forrtl: severe (174): SIGSEGV, segmentation fault occurred
Image              PC                Routine            Line        Source            
siesta             0000000000687BB2  Unknown               Unknown  Unknown
siesta             000000000066B54F  Unknown               Unknown  Unknown
siesta             0000000000B6DDBD  Unknown               Unknown  Unknown
siesta             000000000042C7FC  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          00000039C9A1ECDD  Unknown               Unknown  Unknown
siesta             000000000042C729  Unknown               Unknown  Unknown
forrtl: severe (174): SIGSEGV, segmentation fault occurred
Image              PC                Routine            Line        Source            
siesta             0000000000687BB2  Unknown               Unknown  Unknown
siesta             000000000066B54F  Unknown               Unknown  Unknown
siesta             0000000000B6DDBD  Unknown               Unknown  Unknown
siesta             000000000042C7FC  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          00000039C9A1ECDD  Unknown               Unknown  Unknown
siesta             000000000042C729  Unknown               Unknown  Unknown
forrtl: severe (174): SIGSEGV, segmentation fault occurred
Image              PC                Routine            Line        Source            
siesta             0000000000687BB2  Unknown               Unknown  Unknown
siesta             000000000066B54F  Unknown               Unknown  Unknown
siesta             0000000000B6DDBD  Unknown               Unknown  Unknown
siesta             000000000042C7FC  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          00000039C9A1ECDD  Unknown               Unknown  Unknown
siesta             000000000042C729  Unknown               Unknown  Unknown
forrtl: severe (174): SIGSEGV, segmentation fault occurred
Image              PC                Routine            Line        Source            
siesta             0000000000687BB2  Unknown               Unknown  Unknown
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libc.so.6          00000039C9A1ECDD  Unknown               Unknown  Unknown
siesta             000000000042C729  Unknown               Unknown  Unknown
forrtl: severe (174): SIGSEGV, segmentation fault occurred
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siesta             0000000000687BB2  Unknown               Unknown  Unknown
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siesta             000000000042C729  Unknown               Unknown  Unknown
forrtl: severe (174): SIGSEGV, segmentation fault occurred
Image              PC                Routine            Line        Source            
siesta             0000000000687BB2  Unknown               Unknown  Unknown
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siesta             000000000042C729  Unknown               Unknown  Unknown
forrtl: severe (174): SIGSEGV, segmentation fault occurred
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siesta             0000000000687BB2  Unknown               Unknown  Unknown
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siesta             000000000042C729  Unknown               Unknown  Unknown
forrtl: severe (174): SIGSEGV, segmentation fault occurred
Image              PC                Routine            Line        Source            
siesta             0000000000687BB2  Unknown               Unknown  Unknown
siesta             000000000066B54F  Unknown               Unknown  Unknown
siesta             0000000000B6DDBD  Unknown               Unknown  Unknown
siesta             000000000042C7FC  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          00000039C9A1ECDD  Unknown               Unknown  Unknown
siesta             000000000042C729  Unknown               Unknown  Unknown
forrtl: severe (174): SIGSEGV, segmentation fault occurred
Image              PC                Routine            Line        Source            
siesta             0000000000687BB2  Unknown               Unknown  Unknown
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siesta             000000000042C7FC  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          00000039C9A1ECDD  Unknown               Unknown  Unknown
siesta             000000000042C729  Unknown               Unknown  Unknown
forrtl: severe (174): SIGSEGV, segmentation fault occurred
Image              PC                Routine            Line        Source            
siesta             0000000000687BB2  Unknown               Unknown  Unknown
siesta             000000000066B54F  Unknown               Unknown  Unknown
siesta             0000000000B6DDBD  Unknown               Unknown  Unknown
siesta             000000000042C7FC  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          00000039C9A1ECDD  Unknown               Unknown  Unknown
siesta             000000000042C729  Unknown               Unknown  Unknown
forrtl: severe (174): SIGSEGV, segmentation fault occurred
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siesta             0000000000687BB2  Unknown               Unknown  Unknown
siesta             000000000066B54F  Unknown               Unknown  Unknown
siesta             0000000000B6DDBD  Unknown               Unknown  Unknown
siesta             000000000042C7FC  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          00000039C9A1ECDD  Unknown               Unknown  Unknown
siesta             000000000042C729  Unknown               Unknown  Unknown
forrtl: severe (174): SIGSEGV, segmentation fault occurred
Image              PC                Routine            Line        Source            
siesta             0000000000687BB2  Unknown               Unknown  Unknown
siesta             000000000066B54F  Unknown               Unknown  Unknown
siesta             0000000000B6DDBD  Unknown               Unknown  Unknown
siesta             000000000042C7FC  Unknown               Unknown  Unknown
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siesta             000000000042C729  Unknown               Unknown  Unknown
forrtl: severe (174): SIGSEGV, segmentation fault occurred
Image              PC                Routine            Line        Source            
siesta             0000000000687BB2  Unknown               Unknown  Unknown
siesta             000000000066B54F  Unknown               Unknown  Unknown
siesta             0000000000B6DDBD  Unknown               Unknown  Unknown
siesta             000000000042C7FC  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          00000039C9A1ECDD  Unknown               Unknown  Unknown
siesta             000000000042C729  Unknown               Unknown  Unknown
yhrun: error: cn1007: tasks 12-13: Exited with exit code 174
yhrun: First task exited 60s ago
yhrun: tasks 14-35: running
yhrun: tasks 0-13: exited abnormally
yhrun: Terminating job step 10506407.0
yhrun: Job step aborted: Waiting up to 2 seconds for job step to finish.
yhrun: error: cn1007: tasks 14-23: Killed

后面尝试不管是一个还是多个节点，使用BM分区，还是使用ulimit -s unlimited 都不行，我现在怀疑是编译的问题，应该如何处理呢
编译器是GNU Fortran (GCC) 4.4.7 20120313 (Red Hat 4.4.7-3)
非常感谢！！
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1楼2018-05-13 10:51:40
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guohuazhong

至尊木虫 (职业作家)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
编译时把优化级别降到-O1或-O0
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

ty7922
2楼2018-05-14 10:56:28
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ty7922

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by guohuazhong at 2018-05-14 10:56:28
编译时把优化级别降到-O1或-O0

是指设置arch.make中的FFLAGS为FFLAGS=-g -O0 吗
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3楼2018-05-15 21:29:21
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guohuazhong

至尊木虫 (职业作家)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by ty7922 at 2018-05-15 21:29:21
是指设置arch.make中的FFLAGS为FFLAGS=-g -O0 吗...

是的，这样还不解决问题的话，就再加编译参数-heap-arrays 64

发自小木虫Android客户端
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4楼2018-05-16 00:46:25
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hpc422

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
2楼: Originally posted by guohuazhong at 2018-05-14 10:56:28
编译时把优化级别降到-O1或-O0

您好，请问我在用vaspkit算弹性常数的时候，出现forrtl: severe (174): SIGSEGV, segmentation fault occurred！请问有什么解决办法嘛
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5楼2023-06-12 10:30:53
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