24小时热门版块排行榜     石溪大学接受考研调剂申请>

【调剂】北京石油化工学院2024年16个专业接受调剂
查看: 2700  |  回复: 15
【悬赏金币】回答本帖问题,作者hbeden将赠送您 100 个金币

hbeden

金虫 (小有名气)

[求助] 求大牛提出修改方法,再现文献中的研究内容已有1人参与

最近看到一篇清华大学毛倩写的《初始碳烟颗粒形成的反应动力学模拟》。想把文献的模拟再现出来。
使用的方法是MS建模 50个蒽分子 密度0.008g/cm3。

编写in文件的思路是
1先赋予初速度
2在298K常温下驰豫
3之后由298K升温到600K
4在600K下运行一定步数
目的:希望观察到蒽分子之间的聚集和蒽分子的分解。

期间遇到的问题有:fix qeq/reax CG convergence failed
                               lost atoms
                               恒温过程nvt可是温度变成了非常接近0的情况
                               分子固定,除了初始很近的发生了聚合现象,其余没啥变化。希望看到分子的无规则运动(即分子有初速度)。

相关的data文件 in文件已上传。自己学习几个月了,没有师兄导师可以交流。毕业在即,实在是改不明白了!求大牛指导!我的QQ616422294求大牛提出修改方法,再现文献中的研究内容
QQ图片20180512093911.png
回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:libolin3@tal.com
  • 附件 1 : 3pah.data
  • 2018-05-12 09:40:47, 365.04 K
  • 附件 2 : in.3pah
  • 2018-05-12 09:42:25, 828 bytes

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

stay fool ,stay hungry
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

brucefan

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我看到有一个问题,就是控温的fix nvt命令中你用的Tdamp参数只有1fs,太小了。改成100fs。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
2楼2018-05-12 16:37:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

专心学术

新虫 (初入文坛)

请问一下你用什么仿真软件做的
3楼2018-05-12 22:14:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

月语星愿

金虫 (小有名气)

楼主的文本编译器是什么软件,看着很舒服的样子,是notepad么?有没有自定义的那个脚本呀。分享一下呗,谢谢。

发自小木虫Android客户端
4楼2018-05-14 19:21:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hbeden

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 专心学术 at 2018-05-12 22:14:40
请问一下你用什么仿真软件做的

LAMMPS
stay fool ,stay hungry
5楼2018-05-15 08:43:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hbeden

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 月语星愿 at 2018-05-14 19:21:48
楼主的文本编译器是什么软件,看着很舒服的样子,是notepad么?有没有自定义的那个脚本呀。分享一下呗,谢谢。

留下你的QQ 我发给你
stay fool ,stay hungry
6楼2018-05-15 08:43:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

腾云驾雾123

新虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by hbeden at 2018-05-15 08:43:32
留下你的QQ 我发给你...

464690924谢谢能帮我传下软件吗

发自小木虫Android客户端
7楼2018-05-17 08:32:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hbeden

金虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 腾云驾雾123 at 2018-05-17 08:32:04
464690924谢谢能帮我传下软件吗
...

LAMMPS官网就有下载的 编写用的是notepad
stay fool ,stay hungry
8楼2018-05-19 10:09:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

腾云驾雾123

新虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by hbeden at 2018-05-19 10:09:41
LAMMPS官网就有下载的 编写用的是notepad...

谢谢,能加你扣扣吗,有偿咨询

发自小木虫Android客户端
9楼2018-05-19 12:20:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hbeden

金虫 (小有名气)

引用回帖:
9楼: Originally posted by 腾云驾雾123 at 2018-05-19 12:20:38
谢谢,能加你扣扣吗,有偿咨询
...

可以加。Q616422294学习交流一下,不用有偿
stay fool ,stay hungry
10楼2018-05-21 13:32:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 hbeden 的主题更新
不应助 确定回帖应助 (注意:应助才可能被奖励,但不允许灌水,必须填写15个字符以上)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 博士白读了 +38 Da_Meng_Zi 2024-04-21 42/2100 2024-04-26 00:30 by zhaojp918
[找工作] 普通院校药学硕士,做合成的,感觉找不到工作 +8 pom戴墨镜 2024-04-24 15/750 2024-04-25 20:50 by pom戴墨镜
[教师之家] 刚博士毕业,入职普通一本高校 +18 保持肌肤 2024-04-20 19/950 2024-04-25 18:30 by lyfbangong
[论文投稿] 催稿后秒拒 +10 lizhengke06 2024-04-19 12/600 2024-04-25 17:50 by 追分筝
[考博] 取博导收留 5+3 zzb777888 2024-04-20 8/400 2024-04-25 17:40 by 那年的旧城
[教师之家] 博士论文被抄袭 +23 和尚敲小木鱼 2024-04-22 39/1950 2024-04-25 15:48 by 和尚敲小木鱼
[基金申请] 两类问题算是白选了~ +7 jurkat.1640 2024-04-23 11/550 2024-04-25 13:06 by 立诛杀曹无伤
[考博] 真的好想读博! +14 wangzhe_bs 2024-04-22 17/850 2024-04-25 11:36 by 庭前花未开
[基金申请] 前同事拿我以前未中的国自然标书申请今年的国自然,现在基金委发来调查函 +33 bjdxyxy 2024-04-19 53/2650 2024-04-25 08:05 by 大雁高飞
[基金申请] 化学结清有情发出来了 +3 starboy7286 2024-04-20 3/150 2024-04-24 15:52 by 嘿,黑贝
[有机交流] 紧急求助,有谁用过三甲基硅醇钾TMSOK吗? 1000+3 genius2008 2024-04-19 10/500 2024-04-24 12:37 by genius2008
[考博] 申博成果界定是根据Jcr分区还是中科院分区 +4 我属驴核动力驴 2024-04-22 5/250 2024-04-24 08:47 by 晓目崇
[教师之家] 找工作过程中碰到好多人问南京某新换校长211的政策,规定如下 +15 ZHONGWU_U 2024-04-21 17/850 2024-04-24 05:12 by juta256
[公派出国] 東京大学 应用化学专业柳田研究室 招收修士/博士生 +5 蝶梦123 2024-04-19 5/250 2024-04-23 22:40 by 90472jvvh
[论文投稿] 无under review,直接DIP,咋么办。 +10 lizhengke06 2024-04-19 16/800 2024-04-23 19:15 by 化学程序员
[教师之家] 发现督导在听课,需要跟TA招呼示意吗?有同学看手机、课件有疏漏算大问题吗? +11 河西夜郎 2024-04-19 11/550 2024-04-23 15:01 by mylifecg
[教师之家] 河海大学常州校区新进的讲师待遇如何?考核要求如何? +3 德国小球迷 2024-04-19 18/900 2024-04-22 19:23 by ZHONGWU_U
[高分子] 请问UV灯是365nm的,那么选光引发剂的波长选多少的?要完全一致吗? +4 engledd2004 2024-04-21 4/200 2024-04-22 16:08 by wangcz23
[论文投稿] 编辑是选国外的好还是国内的好。 +8 lizhengke06 2024-04-20 8/400 2024-04-22 08:58 by cuiyunjian
[硕博家园] 材料工程,二本硕士,值得读吗 +3 简风23 2024-04-20 6/300 2024-04-21 12:19 by 简风23
信息提示
请填处理意见