2018版lammps安装教程（小白专用） - 分子模拟 - LAMMPS/DL_POLY

路能走多远，在于事先准备的有多好。不要看到希望而坚持，只有坚持才会看到希望。

21楼2018-09-15 22:51:12

sbkk

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10楼: Originally posted by llqviper at 2018-08-15 18:44:25
麻烦楼主，我在安装lammps时，第三步输入sudo make ubuntu -j4后出现make:*** Error 2该如何处理

我也是这种情况：
openmpi和mpich都试过
依旧是error2报错

路能走多远，在于事先准备的有多好。不要看到希望而坚持，只有坚持才会看到希望。

22楼2018-09-15 22:52:20

sbkk

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2楼: Originally posted by sbkk at 2018-06-12 21:14:30
楼主，我在按您的教程安装ffwt的时候第二步
2.sudo ./configure --prefix=/usr/local --enable-float
提示 sudo: ./configure: command not found
怎么办？？

大概找到原因了，依赖包没装全

sudo apt-get install build-essential

sudo apt-get install build-essential --fix-missing

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23楼2018-09-15 22:54:21

yjfan0301

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24楼2018-10-01 10:09:05

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24楼: Originally posted by yjfan0301 at 2018-10-01 10:09:05
您好！我按照您的这个教程，在Ubuntu上安装lammps，前面的步骤一直没有报错，但是最后始终不生成lmp_ubuntu文件，反而生成了一个带锁的Obj_mpi文件夹和一个带锁的Obj_ubuntu文件。请问怎么解决呢？

建议选择 mpich 再试一下呢，如果前面 fftw 和 mpich 软件安装都没问题（说明安装的 gcc g++等依赖包都没问题，如果相应软件缺失的话，楼上已经有好心人提示怎么安装依赖包了），后面的 Makefile.mpi 文件再稍加修改一下，不可能会出问题的呢。因为我已经安装了不下10遍了。

工科研究生，工程热物理

25楼2018-10-03 17:15:42

yichangli

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21楼: Originally posted by sbkk at 2018-09-15 22:51:12
楼主能说的具体一点么

操作代码是什么样的？...

设置环境变量，在桌面下打开终端输入gedit .bashrc，在最后面 fi 下面添加下面一行代码（意思是将 /usr/local/bin 这个路径添加为环境变量。执行的时候系统会自动到该目录下寻找文件）
export PATH=/usr/local /bin:$PATH
右上角保存后终端输入命令source .bashrc即可。

工科研究生，工程热物理

26楼2018-10-03 17:21:42

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20楼: Originally posted by sbkk at 2018-09-15 22:50:21
楼主，换成mpich还是有Error2

root@ubuntu:/home/xxx/lammps-22Aug18/src# sudo make ubuntu -j4
.......
.......
/usr/bin/x86_64-linux-gnu-ld: cannot find -lfftw3
collect2: error: ld returned 1 exi ...

换成 mpich 后编译文件选择 Makefile.mpi 而不是 Makefile.ubuntu 哦，这个我在置顶文件中说明了哈

工科研究生，工程热物理

27楼2018-10-03 17:28:57

yichangli

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yichangli: 回帖置顶 2018-10-03 17:40:18

鉴于部分同学在最后一步会出现 Error 2 的错误，我建议安装一开始就选择 mpich 软件，由于发布时间太长小木虫无法修改文章内容，我在知乎中写了篇相同内容的帖子，方便大家参考。

https://zhuanlan.zhihu.com/p/36457551

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工科研究生，工程热物理

28楼2018-10-03 17:40:07

sbkk

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送红花一朵

请问卡在lammps并行安装最后一步是怎么回事？？？
$ sudo make mpi -j

make[1]: Entering directory `/home/xxx/lammps/src'
Gathering installed package information (may take a little while)
make[1]: Leaving directory `/home/xxx/lammps/src'
Compiling LAMMPS for machine mpi
make[1]: Entering directory `/home/xxx/lammps/src/Obj_mpi'
make[1]: Leaving directory `/home/xxx/lammps/src/Obj_mpi'
make[1]: Entering directory `/home/xxx/lammps/src/Obj_mpi'
mpicxx -g -O3 -DLAMMPS_GZIP -DLAMMPS_MEMALIGN=64 -DLMP_USER_OMP -DLMP_USER_INTEL -DMPICH_SKIP_MPICXX -DOMPI_SKIP_MPICXX=1 -c ../compute_erotate_sphere.cpp
make[1]: mpicxx: Command not found
make[1]: *** [compute_erotate_sphere.o] Error 127
make[1]: Leaving directory `/home/xxx/lammps/src/Obj_mpi'
make: *** [mpi] Error 2

换了个命令，也不行

$ sudo make mpich -j

make: *** [mpich] Error 1

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29楼2018-10-04 01:59:01

yichangli

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29楼: Originally posted by sbkk at 2018-10-04 01:59:01
请问卡在lammps并行安装最后一步是怎么回事？？？
$ sudo make mpi -j

make: Entering directory `/home/xxx/lammps/src'
Gathering installed package information (may take a little while)
make: Lea ...

会不会是软件版本问题呢
（可以参考文章开头的软件版本
fftw-3.3.8.tar.gz
lammps-stable.tar.gz (解压后为lammps-16Mar18)
mpich-3.2.tar.gz），或者说之前 mpich 和 FFTW 的安装路径有没有默认 /usr/local/ , 或者是 lammps的支持 pakeage 不要选择 make yes-package ,因为选择全部的话的却会报错。

工科研究生，工程热物理

30楼2018-10-04 10:58:34