[交流] 各位前辈，Material Studio7.0中在Forcite 径向分布函数分析中如何处理set

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薄荷欣

zhanft

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1楼2018-04-01 19:00:24

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赵红霞

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月只蓝: 回帖置顶 2018-04-07 14:56:08
月只蓝: 金币+10, 感谢分享 2018-04-07 15:18:53

help里面有非常详细的说明，

1. 在Edit里面，打开atom selection选中你的目标原子群，选中的方法有很多种，在select by properties里面可以设置按什么来选
2. 选中目标原子群以后，在Edit里面，打开有Edit sets，给命名
3. 命名以后在分析里面的set下拉菜单就可以看到了。

鉴于你是新手，特别提醒，在做RDF的时候，只能分析平衡以后的构型而不是全部构型，要不然就没有意义。

具体操作是，打开RDF分析以后，在set上面有个structure选项，显示你的xtd文件名，最右边有个三个点的按键，点开，默认显示所有轨迹，比如1-2001，如果不改，就是分析所有构型。如果你的轨迹到1000帧的时候平衡了，那么初始的1就改为1000以后的数字，比如改为1501-2001，分析的就是1501帧到2001帧这500个构型，这个时候讨论RDF才有意义。

希望对你有帮助。

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35楼2018-04-02 09:15:04

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薄荷欣

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引用回帖:

35楼: Originally posted by 赵红霞 at 2018-04-02 09:15:04
help里面有非常详细的说明，

1. 在Edit里面，打开atom selection选中你的目标原子群，选中的方法有很多种，在select by properties里面可以设置按什么来选
2. 选中目标原子群以后，在Edit里面，打开有Edit sets ...

非常感谢，受益匪浅

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38楼2018-04-02 12:23:44

星空0206

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体系里加入有好几种分子且都带有氢原子，但是我只想分析某一种分子上的氢，该怎么设置set？

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40楼2018-06-21 17:24:20

hcycjw782

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17楼2018-04-01 20:19:33

郭同学

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应该是在面板里面提前编辑设置吧

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36楼2018-04-02 11:01:47

薄荷欣

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送红花一朵

引用回帖:

1楼: Originally posted by 薄荷欣 at 2018-04-01 19:00:24
各位前辈，Material Studio7.0中在Forcite 径向分布函数分析中，怎么使一个分子的全部的O定义为set1，另一个分子的全部H定义为set2?

QQ图片20180401185833.png...

嗯嗯，好的，谢谢

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37楼2018-04-02 11:24:20

aiwodejia

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引用回帖:

40楼: Originally posted by 星空0206 at 2018-06-21 17:24:20
体系里加入有好几种分子且都带有氢原子，但是我只想分析某一种分子上的氢，该怎么设置set？

这个问题您解决了么？

42楼2019-05-26 11:22:08

匿名

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43楼2019-05-27 11:56:37

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Tesia11

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43楼: Originally posted by 天大化工 at 2019-05-27 11:56:37
我想问一下，作质心-质心径向分布函数的时候，如何选定所有相同分子的质心作set呢？...

求问这个问题解决了吗，我实在不会了

44楼2020-04-28 12:33:04