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乱世飘啦啦啦

新虫 (初入文坛)


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导师让处理高通量测序的数据,本人基本不通怎么办,数据是华大基因那边宏观处理过的压缩包,现在解压都要2个T,我是不是要买移动硬盘,而且之前培训过说文件格式要经过很多转换,我现在是不是还要从基础开始学Perl语言程序,最后还有数据处理分析,我感觉不知从何做起。希望相关专业的人士,处理过这些数据的能指导一下,万分感谢!!

高通量测序


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青蛙快飞

银虫 (正式写手)



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笔记本么,那你就废了

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8楼2018-03-14 11:08:28
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乱世飘啦啦啦

新虫 (初入文坛)


引用回帖:
8楼: Originally posted by 青蛙快飞 at 2018-03-14 11:08:28
笔记本么,那你就废了

是的,所以在想买移动硬盘,要不然没法使,呜呜呜

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10楼2018-03-14 11:30:33
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vagbio

新虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
首先,要分析数据量大的测序数据,不仅要有存储内存,还要有运行内存,估计你的笔记本运行内存也会很悬。此外,分析的话,一方面是自己写代码跑程序分析,另一方面可以考虑试用商业软件,免费试用分析试试,商业软件不用写代码,界面参数的,比较容易上手。最后,我这边有一款商业软件NextGENe,能分析二倍体的高通量测序数据,可以免费用35天的。
21楼2018-03-14 15:17:26
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gslz999

铁虫 (正式写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
食品快速检测技术能合作吗?
25楼2018-03-14 16:32:59
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在水壹方

新虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
看来华大的数据分析很粗糙啊

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27楼2018-03-14 18:19:37
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青蛙快飞

银虫 (正式写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
10楼: Originally posted by 乱世飘啦啦啦 at 2018-03-14 11:30:33
是的,所以在想买移动硬盘,要不然没法使,呜呜呜
...

学Python吧,我就是学的Python,快毕业了。如果是宏基因组的话,好像有开源工具qime2,推荐用miniconda安装。perl的符号太奇奇怪怪了。

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33楼2018-03-14 20:39:53
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我本科研狂

禁虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
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43楼2018-03-14 22:45:43
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BSilence2楼
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coher3楼
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yzwjn4楼
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longwave5楼
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树和鱼9楼
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大虫199222楼
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nono200924楼
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