【调剂】北京石油化工学院2024年16个专业接受调剂
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丹丹酱vicky

新虫 (初入文坛)

[求助] 使用autodock4,在 run autogrid时总是报错已有2人参与

虫友们好!本人电脑小白一个,最近在学习autodock4,按照下图中的教程来进行的,但是运行到run autogrid那一步时总是报错(如下图),麻烦大家看看,会是什么原因呢?因为刚开始用小木虫,一共就21个金币,所以赏金略少,请大家见谅。

使用autodock4,在 run autogrid时总是报错
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使用autodock4,在 run autogrid时总是报错-1
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使用autodock4,在 run autogrid时总是报错-2
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longdlut

捐助贵宾 (著名写手)


蛋白里面有木有金属离子?重新构建一下box,然后对接

发自小木虫Android客户端
2楼2018-01-21 10:41:43
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丹丹酱vicky

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by longdlut at 2018-01-21 10:41:43
蛋白里面有木有金属离子?重新构建一下box,然后对接

谢谢您的回复,蛋白是直接从PDB网上下载的,就是按照教程里处理的,有没有金属不太清楚,刚开始学,一点基础都没有,啥也不懂

发自小木虫Android客户端
3楼2018-01-21 15:06:28
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宋雷宋雷

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

请问你现在的问题解决了吗?我也遇到对接时出错的问题,是否可以请教一下
4楼2018-03-18 14:54:00
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我要去抓妖怪

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
1楼: Originally posted by 丹丹酱vicky at 2018-01-20 15:41:32
虫友们好!本人电脑小白一个,最近在学习autodock4,按照下图中的教程来进行的,但是运行到run autogrid那一步时总是报错(如下图),麻烦大家看看,会是什么原因呢?因为刚开始用小木虫,一共就21个金币,所以赏金 ...

你的问题解决了吗 我最近也在接触分子对接 在运行autogrid4时显示autogrid打不开

发自小木虫IOS客户端
5楼2018-05-25 12:33:04
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沙漠猎人

版主 (正式写手)

【答案】应助回帖

可以试试DOS的命令行,直接用界面点击,经常会出现莫名其妙的错误
www.modekeji.cn
6楼2018-05-25 14:37:48
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丹丹酱vicky

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 宋雷宋雷 at 2018-03-18 14:54:00
请问你现在的问题解决了吗?我也遇到对接时出错的问题,是否可以请教一下

这个问题一直没有解决,还在搁浅
7楼2018-06-26 10:51:31
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丹丹酱vicky

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 沙漠猎人 at 2018-05-25 14:37:48
可以试试DOS的命令行,直接用界面点击,经常会出现莫名其妙的错误

好的,我试试,谢谢!
8楼2018-06-26 10:53:10
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丹丹酱vicky

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 宋雷宋雷 at 2018-03-18 14:54:00
请问你现在的问题解决了吗?我也遇到对接时出错的问题,是否可以请教一下

我这个主要是路径输入不正确

发自小木虫Android客户端
9楼2018-07-19 19:27:45
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