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利用vmd由pdb结构转换psf发生原子成键连接错误，求助
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我使用amber模拟产生了一条轨道 后续分析需要使用psf格式与dcd格式 所以我首先利用amber生成全轨道pdb 再用利用vmd将轨道保存为dcd格式 使用vmd中的automatic psf builder 将pdb格式的分子结构转换为psf格式 在转换的过程中没有报错 但是在转换完成后原子之间的键连接发生错误， 另外我也尝试过直接将amber的轨道直接用vmd载入并将轨道保存为dcd格式 再利用automatic psf builder构建psf格式的文件 在完成后将dcd轨道载入psf后会同样出现原子间的键连接错误 请问这里应该怎么解决 |
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月只蓝: 金币-200, 屏蔽内容, 违规存档, 技术性版块，严禁广告！多次发布广告，从重处罚！ 2018-01-19 09:27:30
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