24小时热门版块排行榜     中国微生物培养皿艺术大赛

查看: 1800  |  回复: 36
【有奖交流】积极回复本帖子,参与交流,就有机会分得作者 生物痞子 的 30 个金币 ,回帖就立即获得 2 个金币,每人有 1 次机会

生物痞子

银虫 (小有名气)


[交流] 在蛋白质模拟体系中,如何增加碳酸根,硫酸根等阴离子的,求赐教

最近要模拟一种蛋白质在不同溶液中的变化情况,在chemdraw中画出了这些离子的结构并保存了pdb结构,然后再ccgenf中获得了top文件和prm文件,然后我要加入到蛋白质的溶液体系中,在vmd中的merge structure中合并的时候,显示需要psf文件,然后就不知道如何得到阴离子的psf文件了,还有就是,如果需要控制溶液中的离子浓度的话,又是怎么操作的呢?麻烦各位,指点指点,或者给我指点一些让我阅读学习的资料,小弟感激不尽啦~~
回复此楼

» 猜你喜欢

» 抢金币啦!回帖就可以得到:

查看全部散金贴

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

生物痞子

银虫 (小有名气)


没人么?
2楼2017-11-13 15:06:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Dr_Jesse

铁杆木虫 (著名写手)


★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
生物痞子(金币+2): 谢谢参与
生物痞子: 金币+10, 有用 2017-11-14 14:06:55
不知道你问的是不是这个意思,你看看我之前回答的两个帖子吧:
http://muchong.com/t-11491060-1-authorid-1123054
http://muchong.com/t-11684714-1-authorid-1123054
希望对你有帮助
3楼2017-11-14 08:10:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sony8620

铁杆木虫 (文坛精英)



生物痞子(金币+2): 谢谢参与
12楼2017-11-14 09:38:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

rrcje030

禁虫 (正式写手)


生物痞子(金币+2): 谢谢参与
本帖内容被屏蔽

15楼2017-11-14 10:11:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

生物痞子

银虫 (小有名气)


引用回帖:
3楼: Originally posted by Dr_Jesse at 2017-11-14 08:10:36
不知道你问的是不是这个意思,你看看我之前回答的两个帖子吧:
http://muchong.com/t-11491060-1-authorid-1123054
http://muchong.com/t-11684714-1-authorid-1123054
希望对你有帮助

你好,非常感谢你的回复,我看了你给的两个链接,差不多就是这个意思,就是要构建类似的离子溶液体系,在里面放蛋白质,进行分子模拟,但是一直没找到具体的操作或者一些指导手册,请问,你能指点一二吗?不胜感激~~
19楼2017-11-14 14:10:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Dr_Jesse

铁杆木虫 (著名写手)


引用回帖:
19楼: Originally posted by 生物痞子 at 2017-11-14 14:10:02
你好,非常感谢你的回复,我看了你给的两个链接,差不多就是这个意思,就是要构建类似的离子溶液体系,在里面放蛋白质,进行分子模拟,但是一直没找到具体的操作或者一些指导手册,请问,你能指点一二吗?不胜感激 ...

哈哈,我也就只知道这一二,接触分子模拟时间不长,了解的东西也不是很深。可以一起讨论进步,但建议找个更牛的更资深的虫友讨论学习。
21楼2017-11-14 15:03:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tableman

木虫之王 (文学泰斗)



生物痞子(金币+2): 谢谢参与
花开富贵   
22楼2017-11-14 15:29:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

生物痞子

银虫 (小有名气)


引用回帖:
21楼: Originally posted by Dr_Jesse at 2017-11-14 15:03:00
哈哈,我也就只知道这一二,接触分子模拟时间不长,了解的东西也不是很深。可以一起讨论进步,但建议找个更牛的更资深的虫友讨论学习。...

谢谢了,以后可以相互交流学习
30楼2017-11-15 14:49:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gdflly08

金虫 (文坛精英)



生物痞子(金币+2): 谢谢参与
麻烦各位,指点指点
36楼2017-11-17 10:57:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

侯木虫

新虫 (小有名气)



生物痞子(金币+2): 谢谢参与
大神,怎么保存成PDB格式

发自小木虫Android客户端
37楼2018-07-09 19:31:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
2017-11-14 08:23   回复  
生物痞子(金币+2): 谢谢参与
发自小木虫IOS客户端
2017-11-14 08:39   回复  
生物痞子(金币+2): 谢谢参与
假大空6楼
2017-11-14 08:44   回复  
生物痞子(金币+2): 谢谢参与
2017-11-14 08:50   回复  
生物痞子(金币+2): 谢谢参与
cxy33118楼
2017-11-14 08:59   回复  
生物痞子(金币+2): 谢谢参与
发自小木虫Android客户端
2017-11-14 09:06   回复  
生物痞子(金币+2): 谢谢参与
发自小木虫Android客户端
longwave10楼
2017-11-14 09:11   回复  
生物痞子(金币+2): 谢谢参与
祝福 发自小木虫Android客户端
dongmings11楼
2017-11-14 09:14   回复  
生物痞子(金币+2): 谢谢参与
发自小木虫IOS客户端
nono200913楼
2017-11-14 09:42   回复  
生物痞子(金币+2): 谢谢参与
发自小木虫Android客户端
wjm1992o214楼
2017-11-14 09:46   回复  
生物痞子(金币+2): 谢谢参与
发自小木虫Android客户端
沙沙鱼16楼
2017-11-14 10:32   回复  
生物痞子(金币+2): 谢谢参与
^_^ 发自小木虫IOS客户端
youngen17楼
2017-11-14 11:12   回复  
生物痞子(金币+2): 谢谢参与
发自小木虫Android客户端
syhorchid18楼
2017-11-14 12:03   回复  
生物痞子(金币+2): 谢谢参与
xhmaohan20楼
2017-11-14 14:43   回复  
生物痞子(金币+2): 谢谢参与
发自小木虫Android客户端
2017-11-14 23:08   回复  
生物痞子(金币+2): 谢谢参与
2017-11-14 23:34   回复  
生物痞子(金币+2): 谢谢参与
2017-11-15 07:33   回复  
生物痞子(金币+2): 谢谢参与
bj200898926楼
2017-11-15 12:43   回复  
生物痞子(金币+2): 谢谢参与
gengxin6027楼
2017-11-15 13:01   回复  
生物痞子(金币+2): 谢谢参与
2017-11-15 14:14   回复  
生物痞子(金币+2): 谢谢参与
up 发自小木虫IOS客户端
tzynew29楼
2017-11-15 14:47   回复  
生物痞子(金币+2): 谢谢参与
绽放201431楼
2017-11-16 13:10   回复  
生物痞子(金币+2): 谢谢参与
雅虎跌32楼
2017-11-16 13:11   回复  
生物痞子(金币+2): 谢谢参与
youngen33楼
2017-11-16 13:41   回复  
wwzzxr34楼
2017-11-16 14:16   回复  
生物痞子(金币+2): 谢谢参与
发自小木虫IOS客户端
雅虎跌35楼
2017-11-17 09:41   回复  
相关版块跳转 我要订阅楼主 生物痞子 的主题更新
提示: 如果您在30分钟内回复过其他散金贴,则可能无法领取此贴金币
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 太折磨人了 +19 cohen106 2018-07-20 20/1000 2018-07-22 01:10 by zmlxhh
[公派出国] 公派读博,不能申请青年千人吗? +11 wind19920222 2018-07-20 23/1150 2018-07-22 00:59 by 川城
[基金申请] 浙江省基金外审结果明天会出来吗? +13 环球梅子 2018-07-18 26/1300 2018-07-21 23:31 by ibaojr
[基金申请] 管理口有知道消息的吗? +22 smileangling 2018-07-20 38/1900 2018-07-21 21:41 by 巫独屠
[论文投稿] 论文插图绘制 +10 FFF 君 2018-07-20 16/800 2018-07-21 17:37 by karl_messi
[论文投稿] 为正在投稿的文章祈福第一波 +15 hcoohboy 2018-07-20 15/750 2018-07-21 13:08 by 豆花妹
[硕博家园] 研究生妈妈要去复学 +16 幸运的小菲菲 2018-07-20 19/950 2018-07-21 12:46 by jpirate
[论文投稿] 要发表论文修改稿投学术论坛中要结集出版算不算公开发表 +3 高庆喜儿 2018-07-19 7/350 2018-07-21 11:00 by 国际科学编辑
[考研] 二本应用化学专业想考研 +4 海与蓝 2018-07-18 5/250 2018-07-20 21:14 by 海与蓝
[环境] 环境类的省级期刊哪种比较容易投稿,速度快的 +5 Sylvia的 2018-07-17 8/400 2018-07-20 11:29 by yanww_219
[考博] 请问如果想要读博的话,对个人发表论文数量有没有要求,英语会要求分数很高吗? +3 Kodar 2018-07-20 3/150 2018-07-20 09:06 by 爱英斯塔
[硕博家园] 单向拉伸测试机构 +3 zysdchina 2018-07-17 3/150 2018-07-19 10:15 by zhou6681
[论文投稿] 审稿人建议 +4 橙子焦糖12 2018-07-19 7/350 2018-07-19 09:56 by tulip
[论文投稿] Submissions with Production Completed (1)什么意思? +3 sandy8793 2018-07-16 4/200 2018-07-19 05:28 by sandy8793
[硕博家园] 公派出国辛酸路 +3 qiaoyt 2018-07-18 5/250 2018-07-18 23:07 by jipengmeng
[基金申请] a类上会 +9 bishy 2018-07-15 9/450 2018-07-17 17:53 by warren8162
[基金申请] 系统不是今天更新吗 时间怎么还是7.3号 +8 XIDOstudio 2018-07-16 11/550 2018-07-17 05:29 by lhlbirds
[硕博家园] 好想去关心她,照顾她 +9 cxh90 2018-07-15 28/1400 2018-07-16 20:52 by cxh90
[基金申请] 工材学部水利口 +10 merchancy 2018-07-15 28/1400 2018-07-16 11:49 by firefox1111
[论文投稿] 光学 +6 风行者jyf 2018-07-16 6/300 2018-07-16 11:16 by 廖小小川
信息提示
请填处理意见