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yclmy

新虫 (初入文坛)


[求助] 细菌的筛选与鉴定已有2人参与

[请教]细菌16S测序后,怎样排除同一样品中测序结果重复的菌株
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15885555334

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
1楼: Originally posted by yclmy at 2017-09-05 16:49:39
细菌16S测序后,怎样排除同一样品中测序结果重复的菌株

你能做16srdan检测吗,在那呀。

发自小木虫Android客户端
2楼2017-09-14 06:07:08
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海大烟酒僧

新虫 (初入文坛)


把测序结果发过来后用mega

发自小木虫Android客户端
3楼2017-09-14 08:54:21
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yclmy

新虫 (初入文坛)


引用回帖:
3楼: Originally posted by 海大烟酒僧 at 2017-09-14 08:54:21
把测序结果发过来后用mega

用mega,怎么判断是重复的菌株?
4楼2017-09-14 22:41:49
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依然自然

新虫 (小有名气)

请问后面有找到排除重复菌的办法吗?

发自小木虫IOS客户端
生命就如旅行。。。。所以要一直笑着
5楼2017-10-27 21:48:12
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liuhaolin3

木虫 (正式写手)


【答案】应助回帖

扩增BOX,然后电泳,电泳图谱一样的就可以认为是重复菌株

发自小木虫Android客户端
6楼2017-10-27 22:21:32
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KunnkA

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

通过 EB1的clustalW2 进行多序列比对,然后建树差不多就能把各个菌分开了
知行合一
7楼2017-10-28 11:22:03
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