【调剂】北京石油化工学院2024年16个专业接受调剂
查看: 2446  |  回复: 34
【悬赏金币】回答本帖问题,作者yafen0628将赠送您 50 个金币

yafen0628

金虫 (正式写手)

[求助] PCR污染,存在假阳性带,,盼大神急救已有3人参与

我在PCR过程中遇到很奇葩的现象,阴性对照组(模板为水),会P出来阳性条带,而且与目的带(目的带在186bp左右)大小在同一位置。
1,尝试了更换不同的退火温度(58/62/65),假阳性带依然存在。。。。,
2,曾经以为假阳性带会是交叉引物二聚体类产物,尝试了PCR体系中添加5%DMSO以及将引物100℃煮沸再用,结果还是存在假阳性。。
3,试着换掉了TAQ酶及DNTP还有水,依然是徒劳。。。

下图的左一模板为水,后面依次为不同浓度的阳性模板。。PCR的退火温度为58℃,循环数目35.

我想请教下各位大神,还有什么好的办法来找到PCR污染或者假阳性带的原因,或者是不是因为目的带偏小,所以才会遇到这种问题呢,尝试了各种办法,最近真是被愁死了,要P疯了。。。

PCR污染,存在假阳性带,,盼大神急救
20170516  HHV8 35 cycle.JPG
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

971731043

新虫 (职业作家)

可以在超净台里试试,可能引物被污染了

发自小木虫Android客户端
5楼2017-06-23 09:04:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

781055707

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
气溶胶污染,换引物,在做下去也不会太好的。
采菊东篱下,悠然见南山。
6楼2017-06-23 10:39:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

as1688816

木虫 (正式写手)

估计是酶问题?你是不是用的mix扩的?可以换个牌子试试,或者不用mix

发自小木虫Android客户端
2楼2017-06-22 23:21:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yafen0628

金虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 781055707 at 2017-06-23 10:39:56
气溶胶污染,换引物,在做下去也不会太好的。

重新开启了新合成的引物,结果是一样的。然后重新设计了其他的引物(目的片段均比较小,小于200),还是有这种现象出现。难道会是PCR的退火温度需要再摸索?

发自小木虫IOS客户端
7楼2017-06-23 13:04:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

as1688816

木虫 (正式写手)


西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2017-06-23 23:23:05
引用回帖:
3楼: Originally posted by yafen0628 at 2017-06-23 06:48:17
不是mix ,酶是用的thermo的
...

哦,那就不知道原因了,我以前也遇到过这种问题,不过我用的是mix,当时换个mix就好了,也怀疑过水有问题,不过换了很多水还是有带,一般是很短的片段,如果扩的是很长的片段,一般不会有带的。

发自小木虫Android客户端
4楼2017-06-23 08:30:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

yafen0628

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by as1688816 at 2017-06-22 23:21:05
估计是酶问题?你是不是用的mix扩的?可以换个牌子试试,或者不用mix

不是mix ,酶是用的thermo的

发自小木虫IOS客户端
3楼2017-06-23 06:48:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yafen0628

金虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 971731043 at 2017-06-23 09:04:09
可以在超净台里试试,可能引物被污染了

在超净台试过了,抢也换了其他的。。。然而,没有用。。。

发自小木虫IOS客户端
8楼2017-06-23 13:06:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

971731043

新虫 (职业作家)

引用回帖:
8楼: Originally posted by yafen0628 at 2017-06-23 13:06:26
在超净台试过了,抢也换了其他的。。。然而,没有用。。。
...

可能你的引物母液就已经被污染了

发自小木虫Android客户端
9楼2017-06-23 14:42:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

781055707

木虫 (著名写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by yafen0628 at 2017-06-23 13:04:52
重新开启了新合成的引物,结果是一样的。然后重新设计了其他的引物(目的片段均比较小,小于200),还是有这种现象出现。难道会是PCR的退火温度需要再摸索?
...

换其他基因呀。
采菊东篱下,悠然见南山。
10楼2017-06-23 15:31:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 yafen0628 的主题更新
不应助 确定回帖应助 (注意:应助才可能被奖励,但不允许灌水,必须填写15个字符以上)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 发个文章,结果被某学报请的外审PUA了 +3 ziniu168 2024-04-18 8/400 2024-04-18 21:40 by xli1984
[论文投稿] 一审一个审稿人,小修,会怎么样呀? +3 林师妹 2024-04-18 3/150 2024-04-18 16:47 by topedit
[有机交流] 傅克酰基化,产率大于百分之一百,求解,很急 90+4 hsn991013 2024-04-15 10/500 2024-04-18 15:38 by lkw0604
[有机交流] 兄弟们帮我看看这两个结构怎么合成 +4 xl2088131 2024-04-17 4/200 2024-04-18 15:16 by 多肽行家
[找工作] 家乡二本高校/沿海传统私企,如何抉择? 10+4 化学巷 2024-04-15 12/600 2024-04-18 10:51 by sayuri0712
[考研] 本科211 277分求调剂 +3 0854通信工程 2024-04-18 4/200 2024-04-18 09:11 by 花花平头哥
[博后之家] 博后进站年龄可以超过35岁? +8 suesong0818 2024-04-14 8/400 2024-04-18 08:38 by charles-c
[基金申请] 申请省自然科学基金,研究区能否是省外区域 100+3 喜欢兔兔的我 2024-04-15 11/550 2024-04-17 23:49 by 喜欢兔兔的我
[有机交流] 怎么清洗烧瓶 20+5 ww34523 2024-04-16 6/300 2024-04-17 15:20 by 591950582
[论文投稿] MDPI初审7天,是不是被拒 20+6 applegirl5762 2024-04-15 8/400 2024-04-17 08:49 by bobvan
[考研] 345 求调剂 +5 南风轻语5 2024-04-12 7/350 2024-04-17 07:58 by 机械考研学生
[考研] 332求调剂 +3 木叶下1999 2024-04-16 5/250 2024-04-17 00:56 by angeliar
[考博] 25年申博求助,射频方向 +4 SherlockAH 2024-04-15 10/500 2024-04-16 18:06 by ljysudaee
[考研] 求调剂 +4 鹿萌月yy 2024-04-15 5/250 2024-04-16 16:16 by chenweiwade
[考研] 320求调剂 +5 陆志伟 2024-04-15 5/250 2024-04-16 11:11 by 19862091
[考研] 求调剂 +4 桃岸雪 2024-04-15 5/250 2024-04-15 18:49 by mthwyj
[考研] 278求调剂 +4 月亮就蒜 2024-04-13 5/250 2024-04-14 23:03 by 永字号
[考研] 309求调剂 +3 留不住放不下 2024-04-14 6/300 2024-04-14 15:28 by 19902169
[考研] 323求调剂 +15 啊Q精神~ 2024-04-13 17/850 2024-04-14 12:44 by qjhawk
[考研] 277求调剂 +10 尊的很想上学 2024-04-12 11/550 2024-04-13 07:11 by coco1981
信息提示
请填处理意见