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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 针对某一菌属进行PCR
【调剂】北京石油化工学院2024年16个专业接受调剂
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MA598324143

金虫 (小有名气)

[交流] 针对某一菌属进行PCR

我想了解一下，能否针对某一菌属的16S设计相应的引物，然后对这一属的菌进行定量PCR。
目前，我了解的更多的是针对某一菌种进行引物设计，然后进行相应的定量PCR对其进行定量分析。
我想扩大一下范围，针对这一菌所在的属（Genus）层次进行引物的设计，从而确定这以Genus在所有菌中占有的比例，进行定量的分析~~不知能不能行？？
希望大神能够指导~~~~
谢谢！！！
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加油，加油！！！
1楼2017-06-21 10:43:22
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MA598324143

金虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 低调5238 at 2017-06-21 17:25:54
楼主，有没有定量这方面的参考文献呀

这是我的一个实验方案的构思方法之一，如果能成就会简单好多~~要不然测高通量那成本太高了

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加油，加油！！！
6楼2017-06-21 20:57:26
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低调5238

铜虫 (小有名气)
★
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我现在做的是用一个已知的菌，然后提dna，然后十倍剃度稀释，共7个浓度，每个浓度3个平行，然后做qPCR，但是怎么做标曲啊，求指导一下。。。

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13楼2017-06-24 00:00:44
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普通回帖

gengxin60
2楼2017-06-21 10:57:27
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MA598324143

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by gengxin60 at 2017-06-21 10:57:27

握手可不会得金币的~~~给点有用的信息啊！！兄弟~~
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加油，加油！！！
3楼2017-06-21 11:14:46
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低调5238

铜虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
我去，我最近也要做类似的工作，不过我要定量真菌

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4楼2017-06-21 17:25:21
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低调5238

铜虫 (小有名气)
楼主，有没有定量这方面的参考文献呀

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5楼2017-06-21 17:25:54
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MA598324143

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 低调5238 at 2017-06-21 17:25:21
我去，我最近也要做类似的工作，不过我要定量真菌

如果只针对真菌是有通用引物的~~我的想法是针对其中某一属层次的进行定量

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7楼2017-06-21 20:58:57
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低调5238

铜虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
6楼: Originally posted by MA598324143 at 2017-06-21 20:57:26
这是我的一个实验方案的构思方法之一，如果能成就会简单好多~~要不然测高通量那成本太高了
...

现在扩增子测序不算贵呀，做定量也不便宜多少吧。。。

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8楼2017-06-21 23:25:44
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MA598324143

金虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 低调5238 at 2017-06-21 23:25:44
现在扩增子测序不算贵呀，做定量也不便宜多少吧。。。
...

是吗？？不应该吧，高通量测序怎么也得500多一个样品吧，我自己做一个样品的PCR成本能有这高？？

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加油，加油！！！
9楼2017-06-22 07:20:02
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小冀-

版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
可以看看研究微生物菌群和微生态的文章，会对各菌种进行定量

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···
10楼2017-06-23 14:56:52
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